38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0605 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0605  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  144  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.693547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3990  hypothetical protein  80.28 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0104761  normal  0.0885826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  74.29 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  70.42 
 
 		 79 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  70.42 
 
 		 79 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  69.01 
 
 		 79 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  67.61 
 
 		 79 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  64.29 
 
 		 78 aa  97.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  67.61 
 
 		 77 aa  97.1  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  62.5 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  65.71 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3891  hypothetical protein  60.56 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  63.38 
 
 		 74 aa  90.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  61.43 
 
 		 77 aa  90.5  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  60 
 
 		 76 aa  90.5  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  55.71 
 
 		 74 aa  87.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  60.56 
 
 		 80 aa  87.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  60 
 
 		 74 aa  87  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  52.7 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  61.11 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  58.33 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  54.29 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  55.41 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0308  hypothetical protein  53.42 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0957  putative transposase  51.43 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  54.29 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3522  hypothetical protein  58.46 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  52.24 
 
 		 73 aa  71.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  53.45 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1509  hypothetical protein  57.89 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255702  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3374  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  42.25 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  40.58 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  39.13 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1905  hypothetical protein  40.3 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1351  hypothetical protein  41.27 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2014  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>