51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0861 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  151  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  84.29 
 
 
78 aa  120  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  68.92 
 
 
76 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  67.12 
 
 
77 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  65.75 
 
 
78 aa  100  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  58.33 
 
 
78 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  58.9 
 
 
79 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  60.56 
 
 
77 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  59.72 
 
 
88 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  60.56 
 
 
79 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  58.33 
 
 
80 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  59.72 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3891  hypothetical protein  59.15 
 
 
79 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  59.15 
 
 
84 aa  90.5  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  61.97 
 
 
81 aa  90.5  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  56.34 
 
 
74 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  56.34 
 
 
79 aa  87.8  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  56.34 
 
 
79 aa  87.8  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  54.67 
 
 
84 aa  87  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0605  hypothetical protein  52.7 
 
 
73 aa  84.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.693547  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3990  hypothetical protein  54.93 
 
 
94 aa  83.6  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0104761  normal  0.0885826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  54.29 
 
 
74 aa  82.8  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  50.68 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0957  putative transposase  52.7 
 
 
77 aa  80.9  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3522  hypothetical protein  55.88 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  49.3 
 
 
74 aa  78.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1509  hypothetical protein  56.9 
 
 
67 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255702  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  44.29 
 
 
73 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  52.54 
 
 
64 aa  68.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3374  hypothetical protein  47.14 
 
 
75 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23749  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0308  hypothetical protein  47.22 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  44.29 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  44.93 
 
 
81 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1351  hypothetical protein  45.71 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1292  hypothetical protein  46.27 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2574  hypothetical protein  46.27 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1456  hypothetical protein  45.59 
 
 
95 aa  53.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0707022  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  40.85 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3496  hypothetical protein  43.28 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1905  hypothetical protein  43.94 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0736  hypothetical protein  41.79 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2654  hypothetical protein  41.79 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.440731  normal  0.75621 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2360  hypothetical protein  41.79 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.811428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35620  hypothetical protein  41.79 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2014  hypothetical protein  42.42 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1326  hypothetical protein  41.18 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000180053  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4204  hypothetical protein  42.42 
 
 
89 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal  0.501922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2689  hypothetical protein  39.39 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0316496  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2901  hypothetical protein  39.39 
 
 
80 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224891  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1560  hypothetical protein  40.68 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.629361  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>