48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1292 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1292  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0736  hypothetical protein  92.59 
 
 		 81 aa  154  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35620  hypothetical protein  91.25 
 
 		 81 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2360  hypothetical protein  92.41 
 
 		 80 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.811428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2574  hypothetical protein  91.14 
 
 		 80 aa  148  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3496  hypothetical protein  91.14 
 
 		 81 aa  148  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2654  hypothetical protein  88.61 
 
 		 81 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.440731  normal  0.75621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1351  hypothetical protein  85.19 
 
 		 81 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  91.55 
 
 		 74 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  82.28 
 
 		 81 aa  134  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2901  hypothetical protein  84.81 
 
 		 80 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1905  hypothetical protein  82.28 
 
 		 80 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1326  hypothetical protein  88.57 
 
 		 78 aa  131  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000180053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1456  hypothetical protein  77.78 
 
 		 95 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0707022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2689  hypothetical protein  80.26 
 
 		 91 aa  130  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0316496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2014  hypothetical protein  91.04 
 
 		 84 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4204  hypothetical protein  80 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal  0.501922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1560  hypothetical protein  82.26 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.629361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3861  hypothetical protein  51.47 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.385312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  49.3 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  46.38 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  42.86 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  46.27 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  47.22 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  47.22 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  47.3 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  46.88 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  42.47 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  47.69 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  44.78 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  44 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  47.69 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  49.23 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  47.69 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  40.62 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  46.15 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  40.91 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  45.59 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  44.78 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  41.54 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2036  hypothetical protein  36.23 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  45.28 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0957  putative transposase  40.54 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  35.62 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3891  hypothetical protein  36.36 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0308  hypothetical protein  41.1 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>