31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3861 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3861  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  184  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.385312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2689  hypothetical protein  46.58 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0316496  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4204  hypothetical protein  48.53 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal  0.501922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1292  hypothetical protein  51.47 
 
 
81 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2901  hypothetical protein  47.14 
 
 
80 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224891  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35620  hypothetical protein  48.53 
 
 
81 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3496  hypothetical protein  48.53 
 
 
81 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2360  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.811428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0736  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2654  hypothetical protein  48.53 
 
 
81 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.440731  normal  0.75621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1905  hypothetical protein  45.07 
 
 
80 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1351  hypothetical protein  53.23 
 
 
81 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2014  hypothetical protein  50.79 
 
 
84 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1456  hypothetical protein  46.97 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0707022  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2574  hypothetical protein  47.06 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  50 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1326  hypothetical protein  44.44 
 
 
78 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000180053  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1560  hypothetical protein  44.59 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.629361  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  34.12 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  39.74 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  42.47 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  35.62 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  39.24 
 
 
77 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  41.1 
 
 
79 aa  43.5  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  40.28 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  40.28 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  43.08 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  40.26 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  39.13 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  42.11 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>