48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1351 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1351  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  166  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2654  hypothetical protein  87.34 
 
 		 81 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.440731  normal  0.75621 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1292  hypothetical protein  85.19 
 
 		 81 aa  142  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0736  hypothetical protein  83.95 
 
 		 81 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3496  hypothetical protein  84.81 
 
 		 81 aa  140  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1905  hypothetical protein  83.75 
 
 		 80 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35620  hypothetical protein  83.75 
 
 		 81 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2574  hypothetical protein  83.33 
 
 		 80 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2360  hypothetical protein  82.05 
 
 		 80 aa  133  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.811428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  88.41 
 
 		 74 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1326  hypothetical protein  78.21 
 
 		 78 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000180053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2901  hypothetical protein  86.96 
 
 		 80 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2689  hypothetical protein  75 
 
 		 91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0316496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2014  hypothetical protein  86.76 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  74.68 
 
 		 81 aa  124  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1456  hypothetical protein  71.6 
 
 		 95 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0707022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4204  hypothetical protein  78.87 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal  0.501922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1560  hypothetical protein  79.03 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.629361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3861  hypothetical protein  53.23 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.385312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  49.21 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  44.74 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  45.07 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  45.71 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  48.44 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  46.27 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  47.22 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  47.22 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  45.83 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  48.48 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  45.71 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  42.47 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  45.33 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  39.73 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  44 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  49.23 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  42.86 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  40.85 
 
 		 74 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  47.69 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  44.87 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  40.85 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  38.89 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2036  hypothetical protein  39.06 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  43.08 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3891  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0605  hypothetical protein  41.27 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.693547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0308  hypothetical protein  41.79 
 
 		 74 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>