46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7450 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  65 
 
 
76 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  60.94 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3891  hypothetical protein  62.71 
 
 
79 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  62.9 
 
 
78 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  59.32 
 
 
77 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  61.02 
 
 
77 aa  77  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  56.67 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  60.71 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  53.97 
 
 
79 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  60 
 
 
74 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  58.33 
 
 
81 aa  73.6  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  57.38 
 
 
84 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  64.29 
 
 
78 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  54.69 
 
 
79 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  54.69 
 
 
79 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  51.61 
 
 
79 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  50.85 
 
 
80 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  52.54 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3990  hypothetical protein  55.36 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0104761  normal  0.0885826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0605  hypothetical protein  53.45 
 
 
73 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.693547  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  53.57 
 
 
74 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3522  hypothetical protein  61.67 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  55.36 
 
 
74 aa  66.6  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1509  hypothetical protein  51.79 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255702  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  51.61 
 
 
78 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  52.83 
 
 
73 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  41.54 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0308  hypothetical protein  45 
 
 
74 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3374  hypothetical protein  46.55 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23749  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0957  putative transposase  46.43 
 
 
77 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  47.27 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  42.11 
 
 
74 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1351  hypothetical protein  43.08 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2574  hypothetical protein  48.08 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  39.29 
 
 
73 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1456  hypothetical protein  46.15 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0707022  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1292  hypothetical protein  45.28 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0736  hypothetical protein  45.28 
 
 
81 aa  42.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2654  hypothetical protein  43.4 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.440731  normal  0.75621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1905  hypothetical protein  40 
 
 
80 aa  42  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3496  hypothetical protein  44.23 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1326  hypothetical protein  40 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000180053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2901  hypothetical protein  39.06 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224891  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4204  hypothetical protein  43.86 
 
 
89 aa  40.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal  0.501922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35620  hypothetical protein  43.4 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>