48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1905 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1905  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  165  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2901  hypothetical protein  83.75 
 
 		 80 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1351  hypothetical protein  83.75 
 
 		 81 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0736  hypothetical protein  82.28 
 
 		 81 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2654  hypothetical protein  82.28 
 
 		 81 aa  133  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.440731  normal  0.75621 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1292  hypothetical protein  82.28 
 
 		 81 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3496  hypothetical protein  79.75 
 
 		 81 aa  130  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  84.29 
 
 		 74 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1326  hypothetical protein  76.92 
 
 		 78 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000180053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35620  hypothetical protein  78.75 
 
 		 81 aa  127  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2574  hypothetical protein  80.26 
 
 		 80 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2689  hypothetical protein  76.39 
 
 		 91 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0316496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2360  hypothetical protein  78.95 
 
 		 80 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.811428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2014  hypothetical protein  84.85 
 
 		 84 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1456  hypothetical protein  78.26 
 
 		 95 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0707022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  70.89 
 
 		 81 aa  117  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4204  hypothetical protein  79.41 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal  0.501922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1560  hypothetical protein  75.81 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.629361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3861  hypothetical protein  45.07 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.385312  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  47.22 
 
 		 78 aa  62  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  43.08 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  45.07 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  43.84 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  43.24 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  46.05 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  46.05 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  41.67 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  43.94 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  38.16 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  44.44 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  43.24 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  41.33 
 
 		 80 aa  50.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  44.62 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  41.79 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  38.57 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  41.79 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  43.94 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  43.24 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  40.28 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  41.54 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3891  hypothetical protein  36 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2036  hypothetical protein  38.98 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0605  hypothetical protein  40.3 
 
 		 73 aa  42.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.693547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  42  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1509  hypothetical protein  42.19 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255702  normal  0.332371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>