32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3522 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3522  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  260  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  56.94 
 
 		 78 aa  84.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3891  hypothetical protein  61.64 
 
 		 79 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  61.9 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  55.88 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  55.88 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  58.73 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  58.73 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3990  hypothetical protein  60 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0104761  normal  0.0885826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  57.14 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  60.32 
 
 		 84 aa  76.6  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  50.7 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  55.22 
 
 		 79 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  57.14 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  54.29 
 
 		 78 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  57.81 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0605  hypothetical protein  58.46 
 
 		 73 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.693547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  50.68 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  49.23 
 
 		 74 aa  69.3  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  49.32 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  61.67 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  48.57 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  48.39 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  45.83 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  55.93 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  46.03 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1509  hypothetical protein  53.45 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255702  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0957  putative transposase  42.42 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0308  hypothetical protein  41.79 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3374  hypothetical protein  41.67 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  41.38 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  43.33 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>