37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3990 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3990  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  189  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0104761  normal  0.0885826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0605  hypothetical protein  80.28 
 
 
73 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.693547  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3096  hypothetical protein  76.06 
 
 
79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1184  hypothetical protein  69.01 
 
 
79 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3551  hypothetical protein  69.01 
 
 
79 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.708415  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0499  hypothetical protein  63.86 
 
 
84 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239068  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3222  hypothetical protein  70.42 
 
 
79 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00664907  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2314  hypothetical protein  65.71 
 
 
78 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00431798  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3531  hypothetical protein  64.94 
 
 
78 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3055  hypothetical protein  68.57 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0689  hypothetical protein  67.61 
 
 
77 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1474  hypothetical protein  68.57 
 
 
77 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3891  hypothetical protein  59.15 
 
 
79 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2834  hypothetical protein  62.86 
 
 
77 aa  93.2  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7751  hypothetical protein  58.57 
 
 
74 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0739  hypothetical protein  61.43 
 
 
76 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0146  hypothetical protein  61.97 
 
 
80 aa  88.6  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3837  hypothetical protein  61.43 
 
 
74 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2090  hypothetical protein  58.57 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0861  hypothetical protein  54.93 
 
 
75 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2604  hypothetical protein  62.86 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0308  hypothetical protein  55.56 
 
 
74 aa  80.1  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2277  hypothetical protein  53.52 
 
 
74 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490522  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3204  hypothetical protein  56.76 
 
 
84 aa  78.2  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.925116  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1003  hypothetical protein  52.86 
 
 
81 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3522  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0957  putative transposase  47.44 
 
 
77 aa  74.7  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1509  hypothetical protein  57.89 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255702  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7450  hypothetical protein  55.36 
 
 
64 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.582357  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3374  hypothetical protein  44.29 
 
 
75 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23749  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2476  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0826573  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3701  hypothetical protein  44.62 
 
 
73 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1844  hypothetical protein  45.07 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.769483  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0428  hypothetical protein  37.66 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1326  hypothetical protein  40.3 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000180053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2014  hypothetical protein  43.08 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3696  conjugal transfer protein  41.27 
 
 
74 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>