296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2515 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  583  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  74.44 
 
 		 285 aa  424  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  75.56 
 
 		 268 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  73.8 
 
 		 274 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  74.44 
 
 		 268 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  67.54 
 
 		 279 aa  367  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  67.29 
 
 		 279 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  68.34 
 
 		 276 aa  363  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  68.34 
 
 		 279 aa  363  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  63.88 
 
 		 292 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  68.05 
 
 		 282 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  62.78 
 
 		 288 aa  341  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  62.41 
 
 		 288 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  65.25 
 
 		 283 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  61.98 
 
 		 299 aa  311  7.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  54.64 
 
 		 292 aa  305  4.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  50.87 
 
 		 297 aa  295  8e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  55.88 
 
 		 303 aa  292  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  51.48 
 
 		 272 aa  290  1e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  56.52 
 
 		 291 aa  285  8e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  51.61 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  54.8 
 
 		 301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  51.79 
 
 		 305 aa  279  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  53.7 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  54.18 
 
 		 287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  54.18 
 
 		 287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  53.23 
 
 		 299 aa  271  7e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  50.38 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  47.53 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  51.39 
 
 		 301 aa  259  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  258  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  50.39 
 
 		 287 aa  258  8e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  47.91 
 
 		 288 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  49.2 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  46.9 
 
 		 282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  47.29 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  45.28 
 
 		 288 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  49.6 
 
 		 297 aa  241  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  46.99 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  52.92 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  43.61 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  45.63 
 
 		 304 aa  235  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  42.36 
 
 		 291 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  49.38 
 
 		 296 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  42.91 
 
 		 285 aa  226  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  43.4 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  49.37 
 
 		 276 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  47.18 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  45.06 
 
 		 318 aa  211  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  45.85 
 
 		 315 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  45.85 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  45.85 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  44.86 
 
 		 251 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  45.45 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  45.45 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  45.45 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  40.61 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  43.25 
 
 		 342 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  44.63 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  42.02 
 
 		 318 aa  193  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  39.72 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  50.91 
 
 		 175 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  54.81 
 
 		 147 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  37.5 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  43.69 
 
 		 273 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  38.89 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  51.39 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  42.29 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  41.87 
 
 		 242 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  46.55 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  45.29 
 
 		 244 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  41.29 
 
 		 229 aa  155  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  38.8 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  39.13 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  46.93 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  37.83 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  36.4 
 
 		 258 aa  153  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  40.26 
 
 		 280 aa  152  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  39.47 
 
 		 267 aa  151  8.999999999999999e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  37.7 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  39.47 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  39.04 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  44.63 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  38.86 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  38.15 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  39.49 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  38.86 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  51.05 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  51.05 
 
 		 247 aa  147  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  37.29 
 
 		 216 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  38.26 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  42 
 
 		 220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  40.43 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  35.71 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  42.94 
 
 		 245 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  38.56 
 
 		 263 aa  145  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  50.7 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  38.99 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  40 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  38.19 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>