More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1095 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  67.82 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  67.43 
 
 		 292 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  67.43 
 
 		 315 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  67.43 
 
 		 292 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  67.05 
 
 		 319 aa  355  5e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  67.05 
 
 		 319 aa  355  5e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  67.05 
 
 		 319 aa  355  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  60.3 
 
 		 342 aa  324  9e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  60.67 
 
 		 342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  51.89 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  50 
 
 		 299 aa  255  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  50.2 
 
 		 287 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  45.15 
 
 		 288 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  48.03 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  45.86 
 
 		 287 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  47.69 
 
 		 299 aa  242  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  49.81 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  44.78 
 
 		 288 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  49.05 
 
 		 285 aa  236  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  49.81 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  49.03 
 
 		 301 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  43.68 
 
 		 288 aa  235  7e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  42.7 
 
 		 291 aa  234  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  46.3 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  45.21 
 
 		 282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  45.69 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.83 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  45.32 
 
 		 288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  43.98 
 
 		 287 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  43.98 
 
 		 287 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  44.74 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  45.32 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  40.37 
 
 		 294 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  43.66 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  43.33 
 
 		 279 aa  225  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  43.02 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  43.02 
 
 		 276 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  42.15 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  45.1 
 
 		 297 aa  222  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  46.82 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  44.15 
 
 		 273 aa  222  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  44.88 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  46.44 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  44.06 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  40.59 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  44.49 
 
 		 289 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  44.32 
 
 		 261 aa  214  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  45.28 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  42.91 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  43.3 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  47.04 
 
 		 299 aa  212  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  43.77 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  43.28 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  40.61 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  46.18 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  40 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  52.02 
 
 		 175 aa  192  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  41.73 
 
 		 318 aa  192  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  43.13 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  38.49 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  55.97 
 
 		 147 aa  168  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  39.75 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  45.51 
 
 		 225 aa  158  9e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  48.77 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  37.39 
 
 		 247 aa  145  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  47.13 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  44.94 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  43.33 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  44.52 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  41.71 
 
 		 220 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  44.69 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  41.99 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  38.67 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  42.7 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  44.31 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  47.26 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  50.76 
 
 		 217 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  44.1 
 
 		 249 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  44.1 
 
 		 249 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  44.1 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  44.97 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  44.1 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  42.58 
 
 		 229 aa  138  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  40.7 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  44.1 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  41.38 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  41.01 
 
 		 243 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  44.1 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  44.91 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  50.78 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  44.1 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  38.12 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  47.33 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  43.42 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  39.33 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  43.42 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  43.42 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  43.05 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  43.05 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>