259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0471 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  603  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  78.6 
 
 		 288 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  78.25 
 
 		 288 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  75.44 
 
 		 299 aa  438  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  70.22 
 
 		 279 aa  417  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  68.75 
 
 		 279 aa  411  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  68.75 
 
 		 276 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  66.79 
 
 		 283 aa  363  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  65.78 
 
 		 274 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  65.4 
 
 		 268 aa  354  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  64.26 
 
 		 268 aa  352  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  60.98 
 
 		 272 aa  348  7e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  63.88 
 
 		 284 aa  343  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  62.22 
 
 		 285 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  61.69 
 
 		 282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  61.98 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  58.74 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  55.56 
 
 		 292 aa  299  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  52.52 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  51.88 
 
 		 305 aa  291  7e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  52.71 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  55.51 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  56.8 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  54.44 
 
 		 301 aa  279  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  47.14 
 
 		 287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  51.88 
 
 		 288 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  45.79 
 
 		 287 aa  269  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  49.8 
 
 		 287 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  50.79 
 
 		 299 aa  266  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  52.09 
 
 		 288 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  49.03 
 
 		 287 aa  262  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  49.03 
 
 		 287 aa  262  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  49.8 
 
 		 284 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  47.49 
 
 		 301 aa  255  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  52.99 
 
 		 289 aa  252  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  46.9 
 
 		 288 aa  248  6e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  46.67 
 
 		 304 aa  248  7e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  45.39 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  45.38 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  43.82 
 
 		 270 aa  241  7.999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  45.38 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  43.73 
 
 		 285 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  47.69 
 
 		 318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  49.03 
 
 		 315 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  49.03 
 
 		 292 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  49.03 
 
 		 292 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  46.3 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  48.65 
 
 		 319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  47.13 
 
 		 276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  48.65 
 
 		 319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  48.65 
 
 		 319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  49.19 
 
 		 273 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  44.96 
 
 		 291 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  48.79 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  46.64 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  41.13 
 
 		 294 aa  225  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  43.88 
 
 		 342 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  42.81 
 
 		 342 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  51.81 
 
 		 175 aa  192  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  40.23 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  39.06 
 
 		 318 aa  185  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  40.33 
 
 		 251 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  57.46 
 
 		 147 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  46.24 
 
 		 247 aa  163  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  46.67 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  41.2 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  40.77 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  37.45 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  38.59 
 
 		 264 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  43.9 
 
 		 244 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  48 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  47.33 
 
 		 242 aa  152  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  37.8 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  35.27 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  41.42 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  42.39 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  38.4 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  44.07 
 
 		 225 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  38.14 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  38.49 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  37.97 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  43.03 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  37.77 
 
 		 267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  45.75 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  48.61 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  42.94 
 
 		 252 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  44.03 
 
 		 252 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  34.75 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  44.03 
 
 		 252 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  44.03 
 
 		 252 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  44.03 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  44.03 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  42.42 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  42.42 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  36.94 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  41.01 
 
 		 218 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  36.76 
 
 		 278 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  37.84 
 
 		 247 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  42.42 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  42.42 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>