287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0641 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  611  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  65.58 
 
 		 299 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  61.59 
 
 		 305 aa  329  4e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  58.17 
 
 		 288 aa  315  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  56.1 
 
 		 303 aa  315  6e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  58.94 
 
 		 288 aa  315  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  55.36 
 
 		 279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  56.21 
 
 		 299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  51.43 
 
 		 274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  53.98 
 
 		 279 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  53.98 
 
 		 276 aa  309  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  51.43 
 
 		 268 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  51.07 
 
 		 268 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  54.85 
 
 		 292 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  55.68 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  52.1 
 
 		 285 aa  298  7e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  55.67 
 
 		 301 aa  298  7e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  50.87 
 
 		 284 aa  295  9e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  52.46 
 
 		 288 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  54.51 
 
 		 287 aa  292  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  54.51 
 
 		 287 aa  292  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  52.11 
 
 		 288 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  53.58 
 
 		 291 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  52.71 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  53.29 
 
 		 302 aa  287  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  56.59 
 
 		 287 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  56.59 
 
 		 287 aa  285  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  51.99 
 
 		 301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  55.04 
 
 		 284 aa  278  6e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  53.96 
 
 		 279 aa  275  5e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  51.72 
 
 		 283 aa  275  7e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  54.2 
 
 		 289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  53.21 
 
 		 282 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  52.82 
 
 		 299 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  51.89 
 
 		 275 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  50.18 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  47.57 
 
 		 272 aa  262  4e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  46.77 
 
 		 304 aa  262  6e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  52.33 
 
 		 297 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  48.03 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  47.69 
 
 		 270 aa  256  3e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  48.03 
 
 		 282 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  48.28 
 
 		 292 aa  254  9e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  50.38 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  50.38 
 
 		 292 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  50 
 
 		 319 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  50 
 
 		 319 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  50 
 
 		 319 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  45.56 
 
 		 288 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  46.84 
 
 		 285 aa  249  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  49.61 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  47.15 
 
 		 342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  45.42 
 
 		 291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  45.8 
 
 		 294 aa  242  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  49.03 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  46.72 
 
 		 273 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  48.26 
 
 		 276 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  48.08 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  44.77 
 
 		 261 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  43.58 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  52.3 
 
 		 175 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  44.71 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  61.94 
 
 		 147 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  45.36 
 
 		 225 aa  160  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  36.22 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  45.5 
 
 		 217 aa  156  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  42.16 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  42.79 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  45.95 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  40.87 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  45.98 
 
 		 247 aa  151  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  40.32 
 
 		 244 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  38.03 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  37.36 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  37.4 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  42.13 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  37.35 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  35.98 
 
 		 266 aa  146  5e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  38.71 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  39.52 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  34.78 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  34.47 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  38.8 
 
 		 261 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  41.18 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  36.64 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  38.5 
 
 		 245 aa  142  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  40.76 
 
 		 242 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  39.9 
 
 		 241 aa  142  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  38.21 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  50.36 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  40.32 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  36.96 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  42.78 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  45.96 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  35.21 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  41.85 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  47.22 
 
 		 267 aa  139  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  46.62 
 
 		 263 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  47.95 
 
 		 239 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>