294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1542 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  628  1e-179  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  57.09 
 
 
288 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  57.93 
 
 
282 aa  339  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  57.2 
 
 
282 aa  335  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  54.32 
 
 
294 aa  325  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  57.14 
 
 
291 aa  318  9e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  51.7 
 
 
288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  51.32 
 
 
288 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  46.77 
 
 
297 aa  262  6e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  51.92 
 
 
303 aa  261  8e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  46.21 
 
 
299 aa  259  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  48.91 
 
 
287 aa  258  7e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  48.15 
 
 
301 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  46.84 
 
 
299 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  46.67 
 
 
292 aa  248  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  46.3 
 
 
287 aa  248  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  46.3 
 
 
287 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  45.99 
 
 
315 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  45.99 
 
 
292 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  45.99 
 
 
292 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  48.25 
 
 
301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  45.26 
 
 
318 aa  245  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  48.5 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  45.62 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  45.62 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  45.62 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  47.45 
 
 
289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  43.98 
 
 
342 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  42.53 
 
 
270 aa  242  5e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  44.32 
 
 
279 aa  241  9e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  46.44 
 
 
288 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  48.09 
 
 
284 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  46.4 
 
 
305 aa  240  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  43.94 
 
 
279 aa  239  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  45.96 
 
 
272 aa  238  5.999999999999999e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  43.94 
 
 
276 aa  238  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  46.55 
 
 
287 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  47.13 
 
 
287 aa  237  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  45.63 
 
 
284 aa  235  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  45.11 
 
 
288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  45.29 
 
 
292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  47.02 
 
 
291 aa  233  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  46.21 
 
 
273 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  45.36 
 
 
302 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  43.07 
 
 
342 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  44.74 
 
 
275 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  44.4 
 
 
274 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  44.44 
 
 
268 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  45.77 
 
 
296 aa  225  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  44.79 
 
 
268 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  43.35 
 
 
299 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  45.38 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  44.66 
 
 
276 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  40.23 
 
 
285 aa  216  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  42.32 
 
 
261 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  43.96 
 
 
279 aa  212  7.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  40.77 
 
 
318 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  43.41 
 
 
282 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  41.06 
 
 
283 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  41.09 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  49.7 
 
 
175 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  62.4 
 
 
147 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  35.74 
 
 
251 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  46.03 
 
 
263 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  45.66 
 
 
229 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  49.4 
 
 
266 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  51.32 
 
 
267 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  47.06 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  51.39 
 
 
247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  53.21 
 
 
273 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  46.02 
 
 
244 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  44.57 
 
 
266 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  46.2 
 
 
263 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  46.02 
 
 
225 aa  143  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  43.18 
 
 
261 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  51.7 
 
 
269 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  50.68 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  43.17 
 
 
259 aa  139  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1504  hypothetical protein  48 
 
 
352 aa  139  6e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023514 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  39.82 
 
 
313 aa  139  7e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  40.27 
 
 
317 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  40.81 
 
 
239 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  45.88 
 
 
262 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  40.36 
 
 
239 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  40.27 
 
 
317 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  49.64 
 
 
242 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  50 
 
 
245 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  42.93 
 
 
267 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  51.77 
 
 
275 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  39.82 
 
 
317 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  50.36 
 
 
239 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  44.12 
 
 
249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  48.65 
 
 
268 aa  136  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  43.9 
 
 
247 aa  136  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  41 
 
 
266 aa  136  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  48.3 
 
 
255 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  44.31 
 
 
279 aa  135  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  37.56 
 
 
267 aa  135  8e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  50 
 
 
259 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  47.26 
 
 
248 aa  135  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>