265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0004 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  588  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  74.44 
 
 		 284 aa  424  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  74.81 
 
 		 268 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  72.96 
 
 		 274 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  73.33 
 
 		 268 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  71 
 
 		 279 aa  388  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  72.96 
 
 		 282 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  64.58 
 
 		 288 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  64.86 
 
 		 279 aa  348  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  63.84 
 
 		 288 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  62.88 
 
 		 279 aa  345  7e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  62.88 
 
 		 276 aa  344  8e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  62.22 
 
 		 292 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  60.51 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  62.04 
 
 		 283 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  55.87 
 
 		 292 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  52.1 
 
 		 297 aa  298  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  55.39 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  53.76 
 
 		 305 aa  289  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  55.47 
 
 		 303 aa  289  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  55.48 
 
 		 301 aa  287  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  50.17 
 
 		 299 aa  286  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  51.68 
 
 		 302 aa  278  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  51.25 
 
 		 299 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  53.7 
 
 		 291 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  52.36 
 
 		 301 aa  270  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  50.38 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  49.44 
 
 		 288 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  51.57 
 
 		 287 aa  255  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  51.57 
 
 		 287 aa  255  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  51.75 
 
 		 287 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  50.59 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  48.51 
 
 		 287 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  51.17 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  49.21 
 
 		 284 aa  248  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  48.5 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  45.08 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  46.24 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  43.89 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.63 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  49.38 
 
 		 297 aa  232  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  47.81 
 
 		 273 aa  228  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  48.99 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  48.95 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  43.89 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  42.21 
 
 		 294 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  41.88 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  46.27 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  44.19 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  44.57 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  44.57 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  44.57 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  44.09 
 
 		 318 aa  208  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  44.19 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  44.19 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  44.19 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  43.7 
 
 		 342 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  45.15 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  44.08 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  40 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  40.43 
 
 		 342 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  58.57 
 
 		 147 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  50.6 
 
 		 175 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  41.45 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  39.65 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  43.84 
 
 		 242 aa  165  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  45.79 
 
 		 225 aa  165  9e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  46.45 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  54.14 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  42.11 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  44.04 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  36.64 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  43.16 
 
 		 229 aa  156  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  38.56 
 
 		 262 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  39.34 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  37.72 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  41.88 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  37.1 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  36.26 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  42.63 
 
 		 245 aa  151  8.999999999999999e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  51.39 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  50.7 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  38.94 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  43.93 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  45.45 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  37.24 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  38.4 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  39.04 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  40.89 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  38.86 
 
 		 266 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  37.34 
 
 		 248 aa  149  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  38.46 
 
 		 255 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  39.33 
 
 		 243 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  38.86 
 
 		 280 aa  149  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  41.38 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  41.38 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  38.2 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  40.37 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  50.36 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  40.37 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>