More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6192 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  83.04 
 
 		 342 aa  544  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  65.97 
 
 		 315 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  65.62 
 
 		 319 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  65.62 
 
 		 319 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  66.08 
 
 		 292 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  65.62 
 
 		 319 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  68.94 
 
 		 292 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  65.93 
 
 		 318 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  60.67 
 
 		 275 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  49.61 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  46.85 
 
 		 288 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  41.97 
 
 		 282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  49.2 
 
 		 299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  45.19 
 
 		 285 aa  243  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  40.79 
 
 		 294 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  49.21 
 
 		 287 aa  240  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  44.49 
 
 		 288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  44.05 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  43.07 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  41.24 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  40.56 
 
 		 291 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  48.28 
 
 		 287 aa  233  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  49.07 
 
 		 289 aa  232  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  47.64 
 
 		 292 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  48.43 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  44.14 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  47.64 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  41.9 
 
 		 276 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  42.25 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  46.46 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  46.46 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  41.9 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  42.52 
 
 		 270 aa  224  2e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  46.67 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  46.36 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  44.96 
 
 		 273 aa  222  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  47.45 
 
 		 301 aa  219  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  45.67 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  44.24 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  45.8 
 
 		 297 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  45.91 
 
 		 296 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  43.04 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  45 
 
 		 291 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  42.65 
 
 		 288 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  45.63 
 
 		 274 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  41.11 
 
 		 272 aa  209  5e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  43.8 
 
 		 288 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  45.24 
 
 		 268 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  42.86 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  44.16 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  54.34 
 
 		 175 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  43.48 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  43.25 
 
 		 284 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  43.87 
 
 		 276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  44.49 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  44.19 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  40.86 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  43.73 
 
 		 282 aa  186  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  40.23 
 
 		 279 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  58.78 
 
 		 147 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  45.31 
 
 		 225 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  37.84 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  42.47 
 
 		 273 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  43.59 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  37.55 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  39.67 
 
 		 266 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  35.23 
 
 		 241 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  48.1 
 
 		 275 aa  143  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  36.4 
 
 		 263 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  39.8 
 
 		 220 aa  142  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  33.83 
 
 		 239 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  36.73 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  36.73 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  40.4 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  44.25 
 
 		 243 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  38.14 
 
 		 247 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  40.74 
 
 		 217 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  38.68 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  40.22 
 
 		 235 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  140  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  37.67 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  43.98 
 
 		 247 aa  139  7.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2520  hypothetical protein  40.88 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  36.61 
 
 		 244 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  44.25 
 
 		 241 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  40.59 
 
 		 241 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  36.28 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  42.25 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  39.88 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  35.45 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  36.28 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  36.28 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  35.84 
 
 		 252 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  58.41 
 
 		 263 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  45 
 
 		 247 aa  136  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  42.56 
 
 		 279 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  48.55 
 
 		 280 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  41.3 
 
 		 245 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  40.52 
 
 		 242 aa  136  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>