263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1495 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  100 
 
 
291 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  79.73 
 
 
294 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  68.12 
 
 
282 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  67.39 
 
 
282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  68.42 
 
 
288 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  57.14 
 
 
304 aa  328  7e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  46.64 
 
 
288 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  44.4 
 
 
318 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  44.4 
 
 
315 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  44.4 
 
 
292 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  45.76 
 
 
288 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  44.4 
 
 
292 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  44.03 
 
 
319 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  44.03 
 
 
319 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  44.03 
 
 
319 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  47.69 
 
 
299 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  45.42 
 
 
297 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  40.65 
 
 
342 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  45.04 
 
 
279 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  45.04 
 
 
279 aa  245  6e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  45.21 
 
 
288 aa  245  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  45.83 
 
 
287 aa  244  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  45.83 
 
 
287 aa  244  9e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  45.04 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  44.83 
 
 
288 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  45.8 
 
 
274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  47.66 
 
 
303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  40.56 
 
 
342 aa  241  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  43.46 
 
 
270 aa  241  1e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  45.8 
 
 
268 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  45.95 
 
 
301 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  42.7 
 
 
275 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  47.06 
 
 
268 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  44.87 
 
 
272 aa  240  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  45.39 
 
 
287 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  44.57 
 
 
292 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  44.32 
 
 
289 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  44.19 
 
 
299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  43.56 
 
 
284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  42.36 
 
 
284 aa  232  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  44.27 
 
 
285 aa  232  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  47.33 
 
 
283 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  44.32 
 
 
301 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  45.56 
 
 
305 aa  228  8e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  44.32 
 
 
297 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  45.63 
 
 
292 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  48.25 
 
 
302 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  42.75 
 
 
287 aa  225  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  43.73 
 
 
282 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  45.77 
 
 
291 aa  223  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  46.36 
 
 
299 aa  222  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  40.36 
 
 
273 aa  221  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  42.8 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  40 
 
 
285 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  44.32 
 
 
276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  41.51 
 
 
261 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  41.33 
 
 
296 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  43.73 
 
 
279 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  41.09 
 
 
318 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  41.47 
 
 
251 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  40.78 
 
 
271 aa  189  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  52.41 
 
 
175 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  50.38 
 
 
147 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  45.09 
 
 
245 aa  147  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  46.55 
 
 
225 aa  142  8e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  43.18 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  41.52 
 
 
229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  46.75 
 
 
263 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  41.3 
 
 
317 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  41.3 
 
 
317 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  50.7 
 
 
247 aa  137  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  45.78 
 
 
273 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  40.76 
 
 
317 aa  136  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  48.59 
 
 
266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  43.98 
 
 
263 aa  135  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  42.11 
 
 
229 aa  133  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  46.9 
 
 
239 aa  133  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  46 
 
 
245 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  43.21 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  43.27 
 
 
220 aa  132  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  41.71 
 
 
217 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  48.59 
 
 
244 aa  132  9e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  45.89 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  39.67 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  39.13 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  41.86 
 
 
244 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  34.18 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  41.04 
 
 
240 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  46.21 
 
 
241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  34.45 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  38.59 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  39.36 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  38.15 
 
 
261 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  37.57 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  40.7 
 
 
245 aa  126  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  41.46 
 
 
235 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  47.18 
 
 
258 aa  126  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  40.12 
 
 
218 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  42.6 
 
 
243 aa  125  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  40.12 
 
 
247 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>