154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6074 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  100 
 
 		 142 aa  278  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  100 
 
 		 136 aa  266  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5319  cytochrome c5  75.35 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0203  cytochrome c5  73.24 
 
 		 140 aa  190  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768078  hitchhiker  0.00155687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5177  cytochrome c5  73.24 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129919  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5522  cytochrome c5  72.26 
 
 		 138 aa  187  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0249  cytochrome c5-like protein  72.66 
 
 		 136 aa  176  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47940  cytochrome c5 protein  71.32 
 
 		 134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5267  cytochrome c5  72.36 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  47.06 
 
 		 136 aa  120  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  44.85 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0106  cytochrome c5  43.66 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0239  cytochrome c5  42.96 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  42.14 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  42.54 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  42.54 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  47.06 
 
 		 135 aa  101  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  45.95 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  38.73 
 
 		 137 aa  97.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  42.75 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  38.3 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  48.28 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  43.12 
 
 		 225 aa  90.5  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  43.93 
 
 		 223 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  40.44 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  48.1 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  48.1 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  48.1 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  48.1 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0180  cytochrome c, class I  50 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245077  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  39.84 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  46.84 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  46.84 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  46.84 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  46.84 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  0.0000000000331566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  47.44 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  34.23 
 
 		 302 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0246  cytochrome c  44.58 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00117918  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  34.72 
 
 		 302 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0191  cytochrome c, class I  47.44 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000235852  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  45.57 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  32.89 
 
 		 297 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  40.54 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  44.3 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  35.9 
 
 		 296 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  44.74 
 
 		 230 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  46.75 
 
 		 206 aa  73.6  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4983  cytochrome c, class I  37.4 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  34.88 
 
 		 273 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  32.39 
 
 		 295 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  32.39 
 
 		 295 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  32.39 
 
 		 295 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  55.22 
 
 		 350 aa  70.9  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  44.87 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3332  cytochrome c-type protein  37.78 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2849  cytochrome c family protein  38.75 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000128252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  43.42 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  40.51 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5103  cytochrome c-type protein  36.26 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  46.91 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  37.96 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0971  hypothetical protein  41.77 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  33.62 
 
 		 298 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  33.62 
 
 		 297 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0125  cytochrome c-type protein  35.16 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0350268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0142  cytochrome c5-like protein  35.16 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228578  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0941  hypothetical protein  41.77 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  48 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0156  cytochrome c5-like protein  36.59 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  45.57 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0140  cytochrome c-type protein  34.07 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  45.57 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  42.86 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  41.89 
 
 		 537 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  41.89 
 
 		 537 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2981  cytochrome c-type protein  41.03 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 300 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  43.06 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  30.09 
 
 		 298 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 300 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  32.76 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1307  cytochrome c class I  36.61 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466199 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  44.87 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  39.56 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  41.77 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0083  putative cytochrome c  46.97 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72470  putative cytochrome  41.1 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6290  putative cytochrome  41.1 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0286  putative cytochrome c, class I  38.37 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.721199 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  32.23 
 
 		 297 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  39.24 
 
 		 382 aa  61.6  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  38.89 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>