152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2981 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2981  cytochrome c-type protein  100 
 
 		 95 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3332  cytochrome c-type protein  67.02 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5103  cytochrome c-type protein  69.41 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0125  cytochrome c-type protein  67.06 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0350268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0142  cytochrome c5-like protein  67.06 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0140  cytochrome c-type protein  67.09 
 
 		 100 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0054  cytochrome c-type protein  70 
 
 		 90 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0156  cytochrome c5-like protein  57.29 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2849  cytochrome c family protein  57.89 
 
 		 95 aa  121  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000128252  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6290  putative cytochrome  70.67 
 
 		 97 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72470  putative cytochrome  70.67 
 
 		 97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  47.42 
 
 		 97 aa  95.9  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  51.28 
 
 		 99 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0246  cytochrome c  45.36 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00117918  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  45.36 
 
 		 97 aa  94  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  50 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  50 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  50 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  0.0000000000331566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  50 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0180  cytochrome c, class I  51.95 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245077  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  50 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  50 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  43.3 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0191  cytochrome c, class I  51.95 
 
 		 97 aa  91.3  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000235852  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  42.27 
 
 		 99 aa  90.9  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  43.68 
 
 		 112 aa  90.1  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  46.75 
 
 		 99 aa  88.6  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  47.44 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0095  cytochrome c family protein  52.56 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  50 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  43.48 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  42.31 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  46.58 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  46.38 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  43.66 
 
 		 192 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  36.63 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6104  putative cytochrome c(mono-heme type)  48.57 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415894  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2493  cytochrome c(mono-heme type)  41.43 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0117122  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  43.66 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  43.48 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0286  putative cytochrome c, class I  39.78 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.721199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5267  cytochrome c5  42.86 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0203  cytochrome c5  42.86 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768078  hitchhiker  0.00155687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5177  cytochrome c5  42.86 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129919  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0239  cytochrome c5  39.39 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  44.29 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0260  cytochrome c, class I  40.86 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5319  cytochrome c5  41.56 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0106  cytochrome c5  40.74 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5522  cytochrome c5  40.26 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  40.45 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  38.75 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  38.03 
 
 		 230 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0971  hypothetical protein  43.84 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  38.75 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 293 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  41.89 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  38.75 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0941  hypothetical protein  43.84 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  41.89 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  38.16 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  40.58 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  40.58 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  40.51 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  38.16 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0249  cytochrome c5-like protein  41.67 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47940  cytochrome c5 protein  44.44 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  39.47 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  39.24 
 
 		 298 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  41.1 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  39.24 
 
 		 319 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  36.25 
 
 		 223 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  34.25 
 
 		 382 aa  60.1  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  38.03 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0153  cytochrome c-555, membrane-bound  32.86 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170393  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  44.93 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  34.67 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1741  cytochrome c  34.72 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4918  putative cytochrome c family protein  36.14 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.840892  hitchhiker  0.00914524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  40.85 
 
 		 302 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  40.85 
 
 		 302 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  40.85 
 
 		 296 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0029  cytochrome c class I  43.24 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00298904  hitchhiker  0.00000795968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1715  hypothetical protein  37.8 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128981  normal  0.195089 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  40.51 
 
 		 350 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4983  cytochrome c, class I  41.18 
 
 		 183 aa  57  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1890  hypothetical protein  41.86 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  40.85 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  37.66 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  36.99 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03815  cytochrome C5  38.16 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  36.36 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  36.36 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  36.36 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  36.36 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  36.84 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>