151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2849 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2849  cytochrome c family protein  100 
 
 		 95 aa  199  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000128252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3332  cytochrome c-type protein  61.7 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2981  cytochrome c-type protein  57.89 
 
 		 95 aa  121  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0156  cytochrome c5-like protein  57.45 
 
 		 96 aa  120  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0125  cytochrome c-type protein  54.95 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0350268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0142  cytochrome c5-like protein  54.95 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0140  cytochrome c-type protein  53.85 
 
 		 100 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5103  cytochrome c-type protein  54.95 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0054  cytochrome c-type protein  56.79 
 
 		 90 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6290  putative cytochrome  61.33 
 
 		 97 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72470  putative cytochrome  60 
 
 		 97 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  47.37 
 
 		 99 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  47.37 
 
 		 99 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  47.37 
 
 		 99 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  0.0000000000331566 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  46.32 
 
 		 99 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  48.42 
 
 		 97 aa  97.1  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  46.32 
 
 		 99 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  45.26 
 
 		 99 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  45.26 
 
 		 99 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  45.26 
 
 		 99 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  45.26 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  45.26 
 
 		 97 aa  93.2  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  43.62 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0180  cytochrome c, class I  43.16 
 
 		 97 aa  90.1  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245077  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0246  cytochrome c  42.11 
 
 		 97 aa  87.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00117918  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0191  cytochrome c, class I  48.05 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000235852  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  43.59 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  45.71 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  41.89 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0095  cytochrome c family protein  41.25 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  39.51 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  40.79 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6104  putative cytochrome c(mono-heme type)  47.14 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415894  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0286  putative cytochrome c, class I  37.63 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.721199 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0260  cytochrome c, class I  39.76 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2493  cytochrome c(mono-heme type)  36.36 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0117122  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  42.68 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0203  cytochrome c5  41.33 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768078  hitchhiker  0.00155687 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  40.54 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  36.62 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  38.03 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  36.99 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5319  cytochrome c5  40 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241325 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5522  cytochrome c5  40 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5267  cytochrome c5  38.67 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  39.19 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5177  cytochrome c5  38.67 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129919  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  39.19 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0106  cytochrome c5  39.74 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0239  cytochrome c5  39.24 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  34.18 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  40.58 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1715  hypothetical protein  39.44 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128981  normal  0.195089 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  40.58 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  41.18 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  40 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47940  cytochrome c5 protein  40.54 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0153  cytochrome c-555, membrane-bound  34.78 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170393  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  36.62 
 
 		 230 aa  60.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  35.53 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  35.53 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2304  cytochrome c class I  33.68 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000896467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1741  cytochrome c  33.8 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  50 
 
 		 297 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  38.03 
 
 		 299 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  44.59 
 
 		 294 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  38.03 
 
 		 537 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  38.03 
 
 		 537 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  39.24 
 
 		 300 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0971  hypothetical protein  36 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0917  cytochrome c-555  38.67 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0941  hypothetical protein  37.68 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1890  hypothetical protein  40.26 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  40.74 
 
 		 350 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  36.49 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2463  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.480155  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  37.97 
 
 		 298 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  37.97 
 
 		 319 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0152  cytochrome c-555  34.67 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110389  normal  0.576701 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  34.72 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  34.72 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  34.25 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0103  cytochrome c-555, membrane-bound  35.53 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0151549  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0249  cytochrome c5-like protein  32.47 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0214  cytochrome c class I  30.26 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  43.08 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  35.21 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  41.27 
 
 		 302 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  41.27 
 
 		 302 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2353  cytochrome c class I  34.21 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  34.25 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03815  cytochrome C5  35.37 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  41.27 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  41.54 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2464  cytochrome c, class I  36 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182087  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>