149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0971 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0971  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  283  5.999999999999999e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0941  hypothetical protein  97.04 
 
 		 135 aa  275  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  44.44 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  42.86 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  44.16 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  41.1 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  36.26 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3332  cytochrome c-type protein  50.68 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  37.97 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  39.73 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0140  cytochrome c-type protein  45.24 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0125  cytochrome c-type protein  44.05 
 
 		 100 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0350268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5103  cytochrome c-type protein  44.05 
 
 		 100 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0142  cytochrome c5-like protein  44.05 
 
 		 100 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0054  cytochrome c-type protein  41.86 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  38.16 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  39.02 
 
 		 302 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  39.02 
 
 		 302 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  39.02 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  43.24 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  42.67 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72470  putative cytochrome  43.75 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  39.02 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  39.24 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  40 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  40.23 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  37.18 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  40 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  40 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  38.36 
 
 		 266 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  36.36 
 
 		 230 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2981  cytochrome c-type protein  43.84 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  39.08 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  39.08 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  39.08 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  0.0000000000331566 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  37.8 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  37.8 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0180  cytochrome c, class I  42.47 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245077  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  37.8 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6290  putative cytochrome  42.5 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  38.75 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  38.75 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47940  cytochrome c5 protein  38.67 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 225 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  35 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  40.26 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  37.8 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2493  cytochrome c(mono-heme type)  29.82 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0117122  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  34.12 
 
 		 382 aa  60.8  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2067  cytochrome c family protein  41.46 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2262  cytochrome c family protein  41.46 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2318  cytochrome c family protein  41.46 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2122  cytochrome c family protein  41.46 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0988  cytochrome c family protein  41.46 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  34.09 
 
 		 216 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  36.36 
 
 		 223 aa  60.1  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0191  cytochrome c, class I  41.1 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000235852  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2849  cytochrome c family protein  36 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000128252  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0246  cytochrome c  38.16 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00117918  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  31.37 
 
 		 537 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  31.37 
 
 		 537 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  40 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  37.33 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2464  cytochrome c, class I  34.57 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182087  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5319  cytochrome c5  40.79 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0203  cytochrome c5  39.47 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768078  hitchhiker  0.00155687 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2353  cytochrome c class I  35.44 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  35 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  42.11 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5267  cytochrome c5  39.47 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5177  cytochrome c5  39.47 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129919  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0362  cytochrome c5-like protein  45 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000104978  hitchhiker  0.00044408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0106  cytochrome c5  39.47 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1443  cytochrome c-555, membrane-bound  36.25 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  33.77 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  35.53 
 
 		 293 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  35.37 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  35.37 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2463  cytochrome c, class I  35 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.480155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  39.02 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5522  cytochrome c5  36.84 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0153  cytochrome c-555, membrane-bound  35.53 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170393  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  36.25 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0239  cytochrome c5  38.16 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  35.44 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4058  cytochrome c class I  38.55 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4170  cytochrome c class I  38.55 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  38.36 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0156  cytochrome c5-like protein  37.33 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0214  cytochrome c class I  34.94 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  34.25 
 
 		 294 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4983  cytochrome c, class I  33.77 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2352  cytochrome c class I  32.94 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2117  cytochrome c class I  31.4 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000139618  normal  0.419433 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  37.7 
 
 		 297 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0249  cytochrome c5-like protein  36.84 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>