166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3322 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  100 
 
 		 297 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  80.81 
 
 		 294 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  59.39 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  60.68 
 
 		 300 aa  308  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  64.69 
 
 		 294 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  54.78 
 
 		 319 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  62.72 
 
 		 297 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  63.19 
 
 		 298 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  56.51 
 
 		 297 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  58.97 
 
 		 295 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  58.97 
 
 		 295 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  58.97 
 
 		 295 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  58.42 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  56.81 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  57.33 
 
 		 299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  57.33 
 
 		 299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  57.33 
 
 		 299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  57.33 
 
 		 299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  57.33 
 
 		 299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  57 
 
 		 299 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  55.87 
 
 		 275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  50.82 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  51.21 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  50.84 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  62.09 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  61.44 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  58.75 
 
 		 167 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0029  cytochrome c class I  58.79 
 
 		 163 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00298904  hitchhiker  0.00000795968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1307  cytochrome c class I  52.38 
 
 		 174 aa  165  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  52.07 
 
 		 179 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  52.07 
 
 		 180 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.388168 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  41.05 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4983  cytochrome c, class I  50.27 
 
 		 183 aa  158  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3542  putative cytochrome  53.01 
 
 		 181 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0498  cytochrome c class I  50.31 
 
 		 180 aa  152  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0208  cytochrome c, class I  47.8 
 
 		 180 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  45.98 
 
 		 202 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  36.96 
 
 		 185 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  48.57 
 
 		 148 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  30.19 
 
 		 206 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  38.28 
 
 		 136 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  55.42 
 
 		 103 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  37.06 
 
 		 147 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  53.01 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  47.87 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  54.32 
 
 		 159 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  54.32 
 
 		 159 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  26.34 
 
 		 537 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  26.34 
 
 		 537 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0840  putative cytochrome c5  47.78 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.674138  normal  0.844917 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  45.54 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4918  putative cytochrome c family protein  51.95 
 
 		 137 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.840892  hitchhiker  0.00914524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4170  cytochrome c class I  51.32 
 
 		 140 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4058  cytochrome c class I  51.32 
 
 		 140 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435905  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02091  lipoprotein  51.32 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  46.67 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  47.89 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  40.16 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  44.04 
 
 		 131 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  46.15 
 
 		 112 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  51.22 
 
 		 128 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  45.88 
 
 		 134 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  50 
 
 		 97 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2304  cytochrome c class I  47.06 
 
 		 107 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000896467  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  44 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  29.75 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0362  cytochrome c5-like protein  36.59 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000104978  hitchhiker  0.00044408 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0213  hypothetical protein  41.77 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000412444  hitchhiker  0.00201322 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  42.11 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0917  cytochrome c-555  49.38 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  48.15 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  40.54 
 
 		 135 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2463  cytochrome c, class I  47.25 
 
 		 140 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.480155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0083  putative cytochrome c  42.68 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  36.79 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0233  cytochrome c, class I  43.59 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0215738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  34.04 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  39.56 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  44.87 
 
 		 97 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2464  cytochrome c, class I  45.45 
 
 		 112 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182087  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  42.11 
 
 		 99 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  44.57 
 
 		 97 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  53.42 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2262  cytochrome c family protein  50 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0213  cytochrome c class I  46.91 
 
 		 111 aa  67.4  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0103  cytochrome c-555, membrane-bound  46.91 
 
 		 140 aa  67  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0151549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2318  cytochrome c family protein  50 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0214  cytochrome c class I  45.68 
 
 		 144 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2067  cytochrome c family protein  50 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2122  cytochrome c family protein  50 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  40.79 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0988  cytochrome c family protein  48.72 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  40.79 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  40.79 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  42.67 
 
 		 97 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  40.79 
 
 		 99 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  40.79 
 
 		 99 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  40.79 
 
 		 99 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>