151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5103 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5103  cytochrome c-type protein  100 
 
 		 100 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0125  cytochrome c-type protein  93 
 
 		 100 aa  200  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0350268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0142  cytochrome c5-like protein  93 
 
 		 100 aa  200  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0140  cytochrome c-type protein  93 
 
 		 100 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0054  cytochrome c-type protein  77.91 
 
 		 90 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2981  cytochrome c-type protein  69.41 
 
 		 95 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3332  cytochrome c-type protein  62.11 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0156  cytochrome c5-like protein  58.95 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72470  putative cytochrome  68.09 
 
 		 97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6290  putative cytochrome  75.34 
 
 		 97 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2849  cytochrome c family protein  54.95 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000128252  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  45.83 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0180  cytochrome c, class I  50.67 
 
 		 97 aa  89.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245077  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  47.25 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  49.33 
 
 		 99 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  49.33 
 
 		 99 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  49.33 
 
 		 99 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  0.0000000000331566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  47.44 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  49.33 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0191  cytochrome c, class I  50.67 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000235852  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0246  cytochrome c  45.24 
 
 		 97 aa  87.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00117918  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  48 
 
 		 99 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  46.67 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  45.45 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  48.65 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  47.89 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  48 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0095  cytochrome c family protein  50.7 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  45.95 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  46.48 
 
 		 192 aa  77.4  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2493  cytochrome c(mono-heme type)  42.47 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0117122  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  44.59 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1715  hypothetical protein  46.67 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128981  normal  0.195089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6104  putative cytochrome c(mono-heme type)  48.65 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  47.62 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  42.25 
 
 		 230 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0286  putative cytochrome c, class I  48.57 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.721199 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0941  hypothetical protein  44.05 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0971  hypothetical protein  44.05 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0106  cytochrome c5  41.38 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5267  cytochrome c5  43.42 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5177  cytochrome c5  42.31 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129919  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0260  cytochrome c, class I  45.71 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0203  cytochrome c5  42.11 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768078  hitchhiker  0.00155687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0239  cytochrome c5  39.76 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5319  cytochrome c5  42.11 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  41.33 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  40.58 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  41.33 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1741  cytochrome c  39.44 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  40.58 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  44.93 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  40.79 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0840  putative cytochrome c5  40.54 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.674138  normal  0.844917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  42.03 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  43.66 
 
 		 293 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  41.77 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0153  cytochrome c-555, membrane-bound  37.5 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170393  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  38.16 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  38.16 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5522  cytochrome c5  39.47 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0249  cytochrome c5-like protein  42.47 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  40.54 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  37.66 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  38.57 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  34.94 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  34.94 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  40.51 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  40.79 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  39.24 
 
 		 319 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  38.36 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1443  cytochrome c-555, membrane-bound  49.06 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  39.24 
 
 		 298 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2304  cytochrome c class I  37.33 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000896467  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47940  cytochrome c5 protein  42.86 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0029  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00298904  hitchhiker  0.00000795968 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  40 
 
 		 135 aa  60.1  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  52.73 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  48.08 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  36.62 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  48.08 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  40.79 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  40.79 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0362  cytochrome c5-like protein  43.48 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000104978  hitchhiker  0.00044408 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1890  hypothetical protein  39.13 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  40.85 
 
 		 300 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  42.11 
 
 		 216 aa  57  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  39.44 
 
 		 299 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  39.44 
 
 		 299 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  39.44 
 
 		 299 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  39.44 
 
 		 299 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  39.44 
 
 		 299 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  39.44 
 
 		 299 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  39.44 
 
 		 275 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>