37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4470 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  100 
 
 		 374 aa  748    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  94.65 
 
 		 374 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  53.08 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  35.96 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  56.17 
 
 		 180 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  31.08 
 
 		 447 aa  159  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  45.19 
 
 		 214 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  48.89 
 
 		 206 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  45.1 
 
 		 190 aa  135  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  48.37 
 
 		 199 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  51.89 
 
 		 203 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  53.51 
 
 		 193 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  51.94 
 
 		 188 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  53.7 
 
 		 189 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  54.95 
 
 		 192 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  54.7 
 
 		 199 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  54.95 
 
 		 206 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  46.05 
 
 		 189 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  48.94 
 
 		 199 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  51.85 
 
 		 168 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  52.59 
 
 		 199 aa  123  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  50.89 
 
 		 189 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  42.76 
 
 		 198 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  44.44 
 
 		 171 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  41.32 
 
 		 171 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  35.34 
 
 		 215 aa  88.2  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0119  PilL protein  31.21 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0051  PilL protein  33.8 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.107454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  31.55 
 
 		 164 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  38.53 
 
 		 149 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0059  putative secretion system protein PilL  30 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  32.04 
 
 		 164 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  31.09 
 
 		 137 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  28.81 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.59 
 
 		 2449 aa  47  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0013  type IV pilus biosynthesis protein PilL  26.19 
 
 		 388 aa  46.6  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1374  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.72 
 
 		 2751 aa  43.9  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>