32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3942 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  100 
 
 
149 aa  302  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  44.55 
 
 
164 aa  98.6  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  40.74 
 
 
137 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  38.89 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  34.75 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  39.47 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  40.87 
 
 
193 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  43.27 
 
 
203 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  45.19 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2379  hypothetical protein  34.53 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  36.54 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  37.04 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  40.38 
 
 
198 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  38.94 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  34.62 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  36.44 
 
 
356 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  38.52 
 
 
189 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  38.53 
 
 
374 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  39.64 
 
 
374 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  37.39 
 
 
447 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  37.27 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  34.23 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  38.94 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  37.17 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  35.92 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  38.05 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  35.45 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  33.03 
 
 
377 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  35.66 
 
 
214 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  34.88 
 
 
206 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  36.45 
 
 
189 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  31.2 
 
 
215 aa  56.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>