32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1200 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  91.92 
 
 		 206 aa  363  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  87.44 
 
 		 199 aa  343  7e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  85.93 
 
 		 199 aa  341  5e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  84.42 
 
 		 199 aa  332  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  84.43 
 
 		 192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  83.23 
 
 		 188 aa  266  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  61.26 
 
 		 189 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  61.98 
 
 		 189 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  58.76 
 
 		 190 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  52.63 
 
 		 193 aa  174  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  60.25 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  61.59 
 
 		 168 aa  158  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  52.51 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  56.69 
 
 		 189 aa  137  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  49.32 
 
 		 374 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  49.32 
 
 		 374 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  46.75 
 
 		 180 aa  131  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  44.97 
 
 		 377 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  38.02 
 
 		 447 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  53.57 
 
 		 356 aa  114  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  50.39 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  43.64 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  48.08 
 
 		 171 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  44.35 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  38.69 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  34.62 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  37.72 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  30.84 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  30.17 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2379  hypothetical protein  30.97 
 
 		 144 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>