31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2840 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  100 
 
 		 168 aa  332  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  62.84 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  56.8 
 
 		 203 aa  167  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  61.07 
 
 		 199 aa  165  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  55.42 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  61.07 
 
 		 199 aa  165  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  59.33 
 
 		 199 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  60.4 
 
 		 206 aa  164  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  59.18 
 
 		 189 aa  159  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  58.39 
 
 		 199 aa  157  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  61.76 
 
 		 188 aa  156  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  56.85 
 
 		 189 aa  154  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  68.18 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  55.97 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  58.33 
 
 		 180 aa  131  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  56.14 
 
 		 189 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  51.85 
 
 		 374 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  50.47 
 
 		 374 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  46 
 
 		 377 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  44.12 
 
 		 447 aa  121  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  44.74 
 
 		 214 aa  114  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  55.05 
 
 		 356 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  44.08 
 
 		 206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  47.12 
 
 		 171 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  46.43 
 
 		 171 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  41.13 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  39.47 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  32.73 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  36.04 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  35.14 
 
 		 137 aa  50.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>