32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0628 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  100 
 
 		 164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  44.55 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  28.83 
 
 		 356 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  35.19 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  31.93 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  36.11 
 
 		 447 aa  70.9  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2379  hypothetical protein  27.93 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  36.92 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  36.52 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  34.71 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  31.58 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  37.72 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  35.45 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  32.12 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  34.13 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  36.15 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  36.09 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  35.09 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  37.5 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  34.51 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  34.51 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  32 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  33.03 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  33.96 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  32.04 
 
 		 374 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  32.04 
 
 		 374 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  33.33 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  31.3 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  28 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  24.07 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  28.83 
 
 		 377 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>