35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3736 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  100 
 
 		 356 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  50.61 
 
 		 447 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  38.35 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  36.78 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  35.26 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  50.93 
 
 		 206 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  49.69 
 
 		 214 aa  145  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  42.86 
 
 		 180 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0119  PilL protein  52.94 
 
 		 355 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0051  PilL protein  52.94 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.107454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  43.29 
 
 		 199 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  47.97 
 
 		 199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  44.59 
 
 		 199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  43.9 
 
 		 189 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  52.59 
 
 		 192 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  41.82 
 
 		 206 aa  113  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  47.97 
 
 		 188 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  43.15 
 
 		 189 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  55.05 
 
 		 168 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  41.86 
 
 		 203 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  43.42 
 
 		 198 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  44.44 
 
 		 193 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  40.24 
 
 		 199 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  46.85 
 
 		 171 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  42.68 
 
 		 190 aa  106  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  45.05 
 
 		 171 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  39.26 
 
 		 189 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0059  putative secretion system protein PilL  40.43 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  32.56 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  36.15 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  28.83 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  36.44 
 
 		 149 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  32.46 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2379  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>