31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0668 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  58.79 
 
 		 190 aa  204  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  58.13 
 
 		 193 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  62.96 
 
 		 203 aa  187  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  52.51 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  56.32 
 
 		 199 aa  154  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  46.67 
 
 		 189 aa  153  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  59.48 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  49.71 
 
 		 189 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  62.32 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  64.29 
 
 		 168 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  52.15 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  58.17 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  64.1 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  55 
 
 		 189 aa  125  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  52.71 
 
 		 180 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  49.11 
 
 		 374 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  48.21 
 
 		 374 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  49.53 
 
 		 377 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  43.75 
 
 		 356 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  39.22 
 
 		 447 aa  105  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  40.27 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  37.5 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  46.6 
 
 		 171 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  44.25 
 
 		 171 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  38.52 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  40.38 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  36.7 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  35.45 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  27.27 
 
 		 137 aa  45.1  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  27.12 
 
 		 137 aa  41.2  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>