31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0968 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  371  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  75.28 
 
 
193 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  72.04 
 
 
203 aa  250  9.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  58.79 
 
 
198 aa  204  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  58.76 
 
 
199 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  61.68 
 
 
206 aa  179  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  63.58 
 
 
199 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  59.35 
 
 
189 aa  170  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  65.69 
 
 
188 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  62.91 
 
 
199 aa  167  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  60.13 
 
 
199 aa  166  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  56.36 
 
 
189 aa  162  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  59.15 
 
 
168 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  60.71 
 
 
192 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  56.59 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  45.89 
 
 
374 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  45.21 
 
 
374 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  57.27 
 
 
180 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  42.21 
 
 
377 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  48.6 
 
 
447 aa  108  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  48.33 
 
 
356 aa  104  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  45.26 
 
 
214 aa  99.4  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  49.06 
 
 
206 aa  98.2  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  50 
 
 
171 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  50.49 
 
 
171 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  40.17 
 
 
215 aa  91.7  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  45.19 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  36.04 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  34.51 
 
 
164 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  30.91 
 
 
137 aa  51.6  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  28.18 
 
 
137 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>