32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3300 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  100 
 
 		 171 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  89.47 
 
 		 171 aa  262  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  39.88 
 
 		 214 aa  117  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  39.88 
 
 		 206 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  39.62 
 
 		 447 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  51.4 
 
 		 180 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  39.88 
 
 		 377 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  45.37 
 
 		 374 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  44.44 
 
 		 374 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  41.45 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  42.67 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  42.75 
 
 		 356 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  42.07 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  44.96 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  43.41 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  42.55 
 
 		 199 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  42.57 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  41.84 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  39.47 
 
 		 206 aa  99  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  39.47 
 
 		 203 aa  98.2  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  43.06 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  43.81 
 
 		 189 aa  93.6  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  43.97 
 
 		 198 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  37.06 
 
 		 189 aa  90.5  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  43.27 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  39.82 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  35.45 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  32 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  33.04 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  29.91 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  28.97 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 		 750 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>