31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3007 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  100 
 
 		 180 aa  362  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  53.66 
 
 		 377 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  66.1 
 
 		 374 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  66.1 
 
 		 374 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  49.66 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  48.98 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  46.75 
 
 		 199 aa  131  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  58.33 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  57.55 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  54.95 
 
 		 188 aa  128  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  44.38 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  55.66 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  49.02 
 
 		 193 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  50 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  55.66 
 
 		 199 aa  124  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  55.66 
 
 		 199 aa  124  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  52.21 
 
 		 189 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  57.27 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  52.68 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  43.12 
 
 		 356 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  52.71 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  49.21 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  48.74 
 
 		 447 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  51.4 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  51.4 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  40.31 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  37.04 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  35.19 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  35.85 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  34.29 
 
 		 137 aa  62  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  32.69 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>