31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0532 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  100 
 
 
189 aa  374  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  49.43 
 
 
206 aa  147  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  50 
 
 
199 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  47.98 
 
 
199 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  49.72 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  48.5 
 
 
193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  58.33 
 
 
203 aa  138  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  46.82 
 
 
199 aa  137  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  52.41 
 
 
188 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  50 
 
 
192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  45.93 
 
 
199 aa  134  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  46.79 
 
 
189 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  48.75 
 
 
198 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  51.97 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  50.68 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  52.21 
 
 
180 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  50.42 
 
 
374 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  49.58 
 
 
374 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  48.6 
 
 
377 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  39.61 
 
 
214 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  39.1 
 
 
206 aa  99  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  45.83 
 
 
447 aa  97.8  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  32.8 
 
 
215 aa  95.9  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  39.26 
 
 
356 aa  92  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  44.23 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  43.69 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  35.09 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  37.14 
 
 
149 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  32.11 
 
 
137 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  31.03 
 
 
137 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>