31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2375 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  69.43 
 
 		 203 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  75.28 
 
 		 190 aa  251  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  58.13 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  52.63 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  53.89 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  59.59 
 
 		 189 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  53.11 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  55.76 
 
 		 189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  52.54 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  62.14 
 
 		 168 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  53.11 
 
 		 199 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  68.64 
 
 		 188 aa  160  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  57.52 
 
 		 192 aa  158  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  57.72 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  54.39 
 
 		 374 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  53.51 
 
 		 374 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  44.24 
 
 		 377 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  49.02 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  41.44 
 
 		 447 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  45.75 
 
 		 356 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  46.72 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  50.93 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  48.6 
 
 		 171 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  48.6 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  42.11 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  40.87 
 
 		 149 aa  80.9  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  34.68 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  34.13 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  29.09 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>