32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2768 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  330  5e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  34.75 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  34.93 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  40 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  36.15 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  36.04 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  35.71 
 
 
447 aa  72.4  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  38.89 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  35.38 
 
 
374 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  34.62 
 
 
374 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  34.68 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  36.7 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  32.14 
 
 
192 aa  67.4  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2379  hypothetical protein  36.94 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  31.01 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  33.94 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  32.17 
 
 
377 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  35.85 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  32.71 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  34.91 
 
 
189 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  33.04 
 
 
171 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  30.84 
 
 
199 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  30.84 
 
 
199 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  30.84 
 
 
206 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  33.04 
 
 
171 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  31.73 
 
 
189 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  31.82 
 
 
199 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  28 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  32.82 
 
 
206 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  28.97 
 
 
199 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  33.04 
 
 
214 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  27.78 
 
 
215 aa  41.2  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>