31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2213 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  400  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  69.43 
 
 		 193 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  72.04 
 
 		 190 aa  250  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  62.96 
 
 		 198 aa  187  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  60.25 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  62.11 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  66.91 
 
 		 188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  59.63 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  60.14 
 
 		 168 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  59.01 
 
 		 199 aa  161  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  59.01 
 
 		 199 aa  161  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  57.14 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  52.84 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  62.9 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  58.33 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  52.83 
 
 		 374 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  51.89 
 
 		 374 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  55.66 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  49.06 
 
 		 377 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  48.44 
 
 		 356 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  38.19 
 
 		 214 aa  108  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  39.01 
 
 		 447 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  41.36 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  45.19 
 
 		 171 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  44.55 
 
 		 171 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  36.75 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  43.27 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  34.93 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  34.71 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  34.55 
 
 		 137 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  31.82 
 
 		 137 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>