32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2331 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  396  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  89.45 
 
 		 199 aa  355  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  87.94 
 
 		 199 aa  348  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  87.37 
 
 		 206 aa  344  5e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  87.44 
 
 		 199 aa  343  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  85.03 
 
 		 188 aa  270  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  82.04 
 
 		 192 aa  268  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  60.94 
 
 		 189 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  57.07 
 
 		 189 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  60.13 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  53.11 
 
 		 193 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  59.01 
 
 		 203 aa  161  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  60 
 
 		 168 aa  151  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  58.17 
 
 		 198 aa  148  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  52.38 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  52.59 
 
 		 374 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  52.59 
 
 		 374 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  49.21 
 
 		 180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  50.44 
 
 		 377 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  44.83 
 
 		 356 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  43.51 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  39.67 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  43.66 
 
 		 447 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  48.08 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  47.12 
 
 		 171 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  37.96 
 
 		 215 aa  84.3  9e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  34.23 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  37.5 
 
 		 164 aa  64.7  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  31.03 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  28.97 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  29.36 
 
 		 137 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2379  hypothetical protein  31.4 
 
 		 144 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>