40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1518 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  760    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  52.31 
 
 		 374 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  52.17 
 
 		 374 aa  348  9e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  53.66 
 
 		 180 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  36.45 
 
 		 356 aa  169  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  51.2 
 
 		 206 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  45.18 
 
 		 214 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  30 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  44.24 
 
 		 193 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  44.08 
 
 		 189 aa  125  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  44.97 
 
 		 199 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  50.88 
 
 		 189 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  42.21 
 
 		 190 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  53.7 
 
 		 188 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  51.35 
 
 		 168 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  52.21 
 
 		 199 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  49.06 
 
 		 203 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  51.33 
 
 		 199 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  50.93 
 
 		 206 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  51.4 
 
 		 192 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  50.44 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  49.53 
 
 		 198 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  48.6 
 
 		 189 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  47.37 
 
 		 171 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  45.37 
 
 		 171 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  38.24 
 
 		 215 aa  93.6  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0051  PilL protein  35 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.107454  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0119  PilL protein  35 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  32.17 
 
 		 164 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  33.03 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  28.83 
 
 		 164 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  29.91 
 
 		 137 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0059  putative secretion system protein PilL  28.04 
 
 		 310 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5551  hypothetical protein  38 
 
 		 183 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0612444 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  27.64 
 
 		 137 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5908  hypothetical protein  25 
 
 		 337 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal  0.0547842 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6565  hypothetical protein  31.58 
 
 		 176 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0013  type IV pilus biosynthesis protein PilL  27.03 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4202  hypothetical protein  29.85 
 
 		 148 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6295  hypothetical protein  39.66 
 
 		 195 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>