31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1073 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  279  9e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  75.91 
 
 		 137 aa  218  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2379  hypothetical protein  61.24 
 
 		 144 aa  163  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  38.89 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  31.93 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  32.46 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  29.91 
 
 		 447 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  33.94 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  34.21 
 
 		 206 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  34.82 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  31.09 
 
 		 374 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  30.25 
 
 		 374 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  32.69 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  28.97 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  29.36 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  28.07 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  29.31 
 
 		 206 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  28.57 
 
 		 199 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  28.97 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  27.59 
 
 		 188 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  31.82 
 
 		 203 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  28.45 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  35.14 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  28.44 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  28.44 
 
 		 199 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  31.03 
 
 		 189 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  27.64 
 
 		 377 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  28.44 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  28.18 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  29.09 
 
 		 193 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  27.12 
 
 		 198 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>