32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0453 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  100 
 
 
189 aa  380  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  74.07 
 
 
189 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  61.98 
 
 
199 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  60.21 
 
 
206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  60.94 
 
 
199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  60.21 
 
 
199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  66.46 
 
 
188 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  67.09 
 
 
199 aa  208  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  60.95 
 
 
192 aa  196  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2375  hypothetical protein  55.76 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.192715  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0968  hypothetical protein  56.36 
 
 
190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2213  hypothetical protein  52.84 
 
 
203 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.380889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2840  putative lipoprotein  58.99 
 
 
168 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0668  hypothetical protein  47.18 
 
 
198 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0532  PilL protein  51.18 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4470  type IV B pilus protein  53.7 
 
 
374 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59240  type IV B pilus protein  53.7 
 
 
374 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000264935  hitchhiker  0.0000258548 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1518  hypothetical protein  45.45 
 
 
377 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612277  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3007  PilL protein  43.17 
 
 
180 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  45.75 
 
 
356 aa  118  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  46.26 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  49.17 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  47.17 
 
 
447 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2929  hypothetical protein  45.19 
 
 
171 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492929  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3300  type IV B pilus protein  43.81 
 
 
171 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1746  hypothetical protein  40 
 
 
215 aa  84  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  38.52 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  31.01 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  31.3 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  30.28 
 
 
137 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  28.07 
 
 
137 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2379  hypothetical protein  30.28 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>