19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2379 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2379  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  290  5e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1073  hypothetical protein  61.24 
 
 
137 aa  163  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1035  hypothetical protein  58.33 
 
 
137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3942  PilL protein  34.53 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0628  PilL protein  27.93 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2768  hypothetical protein  36.94 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3736  pilus biogenesis protein  30 
 
 
356 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4164  putative secreted protein  32.46 
 
 
192 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.316795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0623  putative type IV pilus protein  26.89 
 
 
447 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4102  type IV B pilus protein  29.91 
 
 
206 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2331  hypothetical protein  31.4 
 
 
199 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000258774  unclonable  0.000000153991 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0320  type IV B pilus protein  29.57 
 
 
214 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88853  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1413  putative secreted protein  32.73 
 
 
199 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.994462  normal  0.552559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1200  hypothetical protein  30.97 
 
 
199 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215451  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3409  hypothetical protein  30.97 
 
 
206 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1279  putative secreted protein  31.82 
 
 
188 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1180  putative secreted protein  30.91 
 
 
199 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0453  putative secreted protein  30.28 
 
 
189 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1643  putative secreted protein  30.89 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>