264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1078 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1078  putative protein kinase  100 
 
 
527 aa  1001    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.280733  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11730  protein kinase  84.92 
 
 
527 aa  785    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.250424  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 
548 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  25.61 
 
 
579 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  26.06 
 
 
577 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  24.18 
 
 
580 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  22.71 
 
 
576 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  28.92 
 
 
559 aa  99.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 
571 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  26.15 
 
 
571 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  23.18 
 
 
574 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  21.43 
 
 
574 aa  92.8  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  25.25 
 
 
574 aa  92  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  22.41 
 
 
590 aa  92  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  22.4 
 
 
569 aa  90.1  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  22.22 
 
 
576 aa  89.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  25.16 
 
 
572 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  26.8 
 
 
556 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  25.63 
 
 
621 aa  87.4  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  24.95 
 
 
577 aa  86.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  21.43 
 
 
574 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  25.95 
 
 
555 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  25.3 
 
 
585 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  22.35 
 
 
569 aa  85.5  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  21.01 
 
 
586 aa  85.9  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  26.83 
 
 
556 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  25.61 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  27.27 
 
 
556 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  25.15 
 
 
529 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  26.88 
 
 
556 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  22.2 
 
 
606 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  22.34 
 
 
596 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  22.65 
 
 
599 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  28.98 
 
 
533 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  21.33 
 
 
570 aa  74.7  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  20.42 
 
 
589 aa  74.3  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  23.65 
 
 
553 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  21.13 
 
 
610 aa  72.8  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  29.93 
 
 
555 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 
605 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.71 
 
 
747 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  27.01 
 
 
571 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  28.16 
 
 
595 aa  65.1  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  19.96 
 
 
596 aa  62  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7168  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
349 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.644589  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  26.04 
 
 
624 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  26.04 
 
 
624 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  26.04 
 
 
624 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  24.06 
 
 
634 aa  61.2  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5860  serine/threonine protein kinase  30.64 
 
 
482 aa  60.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.628207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  23.21 
 
 
562 aa  60.1  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
468 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  32.93 
 
 
444 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0657  serine/threonine protein kinase  27.19 
 
 
566 aa  58.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1209  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.74 
 
 
557 aa  58.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  24.35 
 
 
626 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3649  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 
450 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  23.49 
 
 
862 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  24.95 
 
 
594 aa  57.4  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0044  serine/threonine-protein kinase  32.18 
 
 
489 aa  57  0.0000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0153881  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
430 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
430 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
431 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  28.22 
 
 
690 aa  57  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.99 
 
 
511 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.33 
 
 
930 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 
666 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  32.53 
 
 
636 aa  55.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  24.86 
 
 
625 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  28.88 
 
 
565 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  22.99 
 
 
641 aa  55.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 
585 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  26.21 
 
 
573 aa  55.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  27.07 
 
 
597 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1818  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.49 
 
 
1287 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.118707  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  32.53 
 
 
963 aa  54.3  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  24.91 
 
 
586 aa  54.3  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  29.07 
 
 
626 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  23.98 
 
 
625 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  25.65 
 
 
582 aa  53.9  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  25 
 
 
667 aa  53.5  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  31.3 
 
 
705 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  28.72 
 
 
563 aa  53.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.11 
 
 
676 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 
573 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.19 
 
 
594 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.61 
 
 
584 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  24.05 
 
 
565 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4222  serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 
551 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.652875  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4030  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.54 
 
 
445 aa  52.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  27.47 
 
 
617 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  26.23 
 
 
615 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2094  protein kinase  30.86 
 
 
654 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285839  normal  0.150566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2621  serine/threonine protein kinase  34.02 
 
 
419 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  27.42 
 
 
328 aa  51.6  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  26.58 
 
 
325 aa  52  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  22.75 
 
 
614 aa  51.6  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  21.99 
 
 
662 aa  52  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.23 
 
 
681 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3775  protein kinase  29.52 
 
 
488 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>