140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88634 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_88634  predicted protein  100 
 
 		 360 aa  736    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.66432  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02938  NUDIX domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G08220)  29.55 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  33.6 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 		 216 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 195 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 195 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  29.17 
 
 		 202 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 189 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  26.35 
 
 		 190 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  28.31 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01610  expressed protein  31.85 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  27.11 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  29.22 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  28.05 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 189 aa  57  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 228 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 228 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 228 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 228 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  26.97 
 
 		 243 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 201 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 228 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 194 aa  54.3  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 244 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 199 aa  53.9  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  25.14 
 
 		 168 aa  53.5  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  25.14 
 
 		 168 aa  53.5  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 223 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 235 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 228 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 242 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  27.33 
 
 		 238 aa  52.8  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1805  NUDIX hydrolase  30.92 
 
 		 194 aa  52.8  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000497318  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  26.9 
 
 		 228 aa  52.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  27.14 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 198 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2465  NUDIX hydrolase  26.24 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1713  NUDIX hydrolase  24.39 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108614  normal  0.043111 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  29.75 
 
 		 204 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 		 207 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 234 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 234 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 		 197 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 195 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 210 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 202 aa  50.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 227 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 211 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  26.67 
 
 		 199 aa  50.4  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  33.07 
 
 		 171 aa  50.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 226 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  29.17 
 
 		 191 aa  49.7  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26210  NUDIX family protein  39.19 
 
 		 237 aa  49.7  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0881576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  26.76 
 
 		 278 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 231 aa  49.7  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_6789  predicted protein  27.61 
 
 		 132 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  27.38 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 227 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  26.96 
 
 		 225 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2377  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 		 195 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000154779  normal  0.335752 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1916  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 		 195 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  27.44 
 
 		 201 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1942  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 		 195 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000158411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1949  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 		 195 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112365  normal  0.784908 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.66 
 
 		 199 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 194 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  25.47 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 178 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  26.49 
 
 		 227 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  25.17 
 
 		 241 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  27.06 
 
 		 239 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5012  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 208 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.66 
 
 		 217 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.66 
 
 		 217 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 214 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.66 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2461  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 199 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.66 
 
 		 427 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.66 
 
 		 427 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 226 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.66 
 
 		 483 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0468  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 202 aa  47  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>