214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30737 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_30737  predicted protein  100 
 
 
186 aa  382  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.19351  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  28.34 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  34.23 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  32.54 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  28.95 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  31.29 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  28.95 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  35.96 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  26.19 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  26.19 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  29.58 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  28.03 
 
 
190 aa  62.4  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  30.72 
 
 
202 aa  62.4  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  30.18 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  30.92 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  28.57 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  29.68 
 
 
216 aa  62  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7303  predicted protein  29.61 
 
 
189 aa  62  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00433512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  32.69 
 
 
191 aa  61.6  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  28.39 
 
 
208 aa  61.2  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 
189 aa  61.2  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  30.5 
 
 
187 aa  61.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30021  predicted protein  32.35 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.856091 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  32.68 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  30.19 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  31.82 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  30.07 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  31.41 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  31.18 
 
 
213 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  33.77 
 
 
365 aa  57.4  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  30.92 
 
 
206 aa  57  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  29.25 
 
 
196 aa  57  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  29.38 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  26.45 
 
 
207 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  29.22 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  28.12 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  29.11 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  30.19 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  33.33 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  25.33 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  27.93 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  28.76 
 
 
205 aa  55.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  28.38 
 
 
192 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  28 
 
 
198 aa  55.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  29.63 
 
 
189 aa  54.7  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  27.7 
 
 
192 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  27.7 
 
 
192 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  27.7 
 
 
192 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  31.67 
 
 
202 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  27.1 
 
 
214 aa  54.7  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  27.44 
 
 
191 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  28.1 
 
 
205 aa  54.7  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  29.03 
 
 
186 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  29.87 
 
 
186 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  27.54 
 
 
230 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  25.29 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  29.87 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  29.87 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  29.87 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  29.93 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  29.25 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  29.87 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  28.39 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  29.87 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0252  peptidyl-tRNA hydrolase  27.81 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0084  peptidyl-tRNA hydrolase  29.03 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  29.87 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  28.57 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  26.63 
 
 
209 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  26.55 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  29.22 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  29.87 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  32.62 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1024  peptidyl-tRNA hydrolase  27.81 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.421531  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0166  peptidyl-tRNA hydrolase  26.95 
 
 
185 aa  52.4  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04025  peptidyl-tRNA hydrolase  27.11 
 
 
219 aa  52.4  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  28.98 
 
 
195 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0663  peptidyl-tRNA hydrolase  28.57 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118368  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  28.39 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02731  peptidyl-tRNA hydrolase  26.78 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  27.89 
 
 
203 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  31.25 
 
 
228 aa  52  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0817  peptidyl-tRNA hydrolase  28.49 
 
 
188 aa  51.6  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00002095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  26.97 
 
 
196 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  31.13 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  27.89 
 
 
210 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  31.37 
 
 
189 aa  51.6  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  30.97 
 
 
188 aa  51.2  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  23.12 
 
 
201 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  27.89 
 
 
210 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  29.93 
 
 
203 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  35.54 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0163  aminoacyl-tRNA hydrolase  31.03 
 
 
158 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1451  aminoacyl-tRNA hydrolase  29.58 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.810799  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  30.32 
 
 
205 aa  50.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1618  peptidyl-tRNA hydrolase  26.62 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  30.32 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02831  peptidyl-tRNA hydrolase  29.13 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.396706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  31.21 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  30.36 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>