93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2237 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2237  hypothetical protein  100 
 
 		 653 aa  1342    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2550  Protein of unknown function DUF1800  85.47 
 
 		 654 aa  1149    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.392949  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2115  Protein of unknown function DUF1800  51.75 
 
 		 628 aa  591  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3566  hypothetical protein  49.18 
 
 		 668 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2504  hypothetical protein  37.82 
 
 		 467 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2391  hypothetical protein  37.82 
 
 		 471 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2349  hypothetical protein  37.56 
 
 		 471 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.475225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1250  hypothetical protein  37.31 
 
 		 471 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3328  hypothetical protein  37.31 
 
 		 487 aa  249  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0104946  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1977  hypothetical protein  37.31 
 
 		 487 aa  249  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132542  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1484  hypothetical protein  37.31 
 
 		 467 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00691345  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2096  hypothetical protein  36.36 
 
 		 471 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5247  hypothetical protein  36.94 
 
 		 500 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6143  hypothetical protein  36.84 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1881  Protein of unknown function DUF1800  35.96 
 
 		 548 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.126804 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1936  hypothetical protein  36.84 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1650  signal peptide protein  34.3 
 
 		 538 aa  237  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2305  hypothetical protein  34.81 
 
 		 513 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1567  Protein of unknown function DUF1800  34.38 
 
 		 545 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00854272  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1960  hypothetical protein  36.32 
 
 		 500 aa  234  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0216977  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1896  Protein of unknown function DUF1800  33.85 
 
 		 541 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018733  normal  0.180633 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1851  hypothetical protein  36.15 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942096  hitchhiker  0.000233455 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1924  hypothetical protein  36.19 
 
 		 515 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947079  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1335  hypothetical protein  35.31 
 
 		 503 aa  220  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  decreased coverage  0.0000870574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1450  hypothetical protein  33.92 
 
 		 605 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0200  Protein of unknown function DUF1800  30.27 
 
 		 470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4237  Protein of unknown function DUF1800  31.46 
 
 		 541 aa  183  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000229991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1788  Protein of unknown function DUF1800  32.83 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2447  hypothetical protein  32.13 
 
 		 399 aa  174  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0601208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1188  Protein of unknown function DUF1800  31.98 
 
 		 453 aa  173  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1610  hypothetical protein  32.31 
 
 		 455 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00247546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1102  Protein of unknown function DUF1800  31.44 
 
 		 458 aa  166  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5993  Protein of unknown function DUF1800  31.63 
 
 		 478 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7109  Protein of unknown function DUF1800  29.32 
 
 		 548 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2472  Protein of unknown function DUF1800  29.44 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.230018  decreased coverage  0.00526107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0047  Protein of unknown function DUF1800  29.83 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0385288  normal  0.588647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0968  hypothetical protein  30.63 
 
 		 440 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2279  hypothetical protein  35.16 
 
 		 311 aa  142  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000123054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0519  hypothetical protein  26.97 
 
 		 465 aa  137  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0166  Protein of unknown function DUF1800  28.8 
 
 		 555 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2770  hypothetical protein  26 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.818772  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2721  hypothetical protein  29.13 
 
 		 572 aa  107  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5539  hypothetical protein  27.97 
 
 		 508 aa  107  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101911  normal  0.180912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3363  hypothetical protein  26.37 
 
 		 578 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.174936 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02838  hypothetical protein  27.45 
 
 		 529 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2282  hypothetical protein  29.43 
 
 		 549 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349659  hitchhiker  0.0000222202 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4005  hypothetical protein  29.87 
 
 		 423 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1793  hypothetical protein  30.99 
 
 		 511 aa  100  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3316  Protein of unknown function DUF1800  26.44 
 
 		 533 aa  100  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6010  hypothetical protein  29.54 
 
 		 533 aa  97.8  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4117  Protein of unknown function DUF1800  25.36 
 
 		 526 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.970573  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4087  hypothetical protein  26.91 
 
 		 500 aa  96.3  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4838  hypothetical protein  25.55 
 
 		 526 aa  94  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4978  hypothetical protein  23.63 
 
 		 495 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4879  hypothetical protein  27.16 
 
 		 532 aa  92  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0484616  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5240  hypothetical protein  29.17 
 
 		 524 aa  90.1  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.091934  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1682  hypothetical protein  26.73 
 
 		 525 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2352  hypothetical protein  27.27 
 
 		 448 aa  89.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.289582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4216  hypothetical protein  27.07 
 
 		 454 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1626  hypothetical protein  28.02 
 
 		 507 aa  89  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0161369  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4696  Protein of unknown function DUF1800  29.8 
 
 		 457 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5024  Protein of unknown function DUF1800  27.22 
 
 		 519 aa  87.4  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0654907  normal  0.102883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3442  Protein of unknown function DUF1800  26.48 
 
 		 496 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24616  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2474  Protein of unknown function DUF1800  28.97 
 
 		 503 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5179  hypothetical protein  32.66 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2184  Protein of unknown function DUF1800  25.65 
 
 		 503 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0521136  normal  0.739812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2867  hypothetical protein  27.44 
 
 		 665 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0773  Protein of unknown function DUF1800  27.35 
 
 		 643 aa  81.3  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3913  hypothetical protein  27.16 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3875  Protein of unknown function DUF1800  31.84 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2182  hypothetical protein  27.52 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1975  hypothetical protein  25.61 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527872  normal  0.596923 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0376  Protein of unknown function DUF1800  27.04 
 
 		 664 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4377  hypothetical protein  25 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.877335 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2391  hypothetical protein  28.05 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0167986  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2159  hypothetical protein  26.09 
 
 		 565 aa  77.4  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5827  hypothetical protein  24.53 
 
 		 464 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0551866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4476  hypothetical protein  25 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3892  hypothetical protein  25 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3483  hypothetical protein  26.09 
 
 		 553 aa  75.1  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000086  hypothetical protein  24.08 
 
 		 522 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2339  hypothetical protein  27.27 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428867  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1384  hypothetical protein  25.16 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478917  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3058  hypothetical protein  24.29 
 
 		 555 aa  70.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417569  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2851  hypothetical protein  25.78 
 
 		 471 aa  70.1  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05702  hypothetical protein  26.48 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06462  hypothetical protein  25.69 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4704  hypothetical protein  24.63 
 
 		 647 aa  54.3  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  23.51 
 
 		 645 aa  53.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2388  hypothetical protein  19.9 
 
 		 604 aa  50.4  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3513  hypothetical protein  27.37 
 
 		 587 aa  49.7  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0370611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4494  hypothetical protein  24.19 
 
 		 635 aa  47.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1206  hypothetical protein  21.95 
 
 		 480 aa  45.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>