92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4377 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4377  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  915    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.877335 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4087  hypothetical protein  68.19 
 
 		 500 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5827  hypothetical protein  93.53 
 
 		 464 aa  868    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0551866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5024  Protein of unknown function DUF1800  63.01 
 
 		 519 aa  643    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0654907  normal  0.102883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1384  hypothetical protein  91.59 
 
 		 535 aa  853    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478917  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1626  hypothetical protein  65.68 
 
 		 507 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0161369  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4476  hypothetical protein  94.18 
 
 		 464 aa  874    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3913  hypothetical protein  98.28 
 
 		 464 aa  905    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3892  hypothetical protein  94.18 
 
 		 464 aa  874    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3442  Protein of unknown function DUF1800  62.77 
 
 		 496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4216  hypothetical protein  61.87 
 
 		 454 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1793  hypothetical protein  49.73 
 
 		 511 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5240  hypothetical protein  48.66 
 
 		 524 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.091934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2851  hypothetical protein  41.29 
 
 		 471 aa  325  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2339  hypothetical protein  43.72 
 
 		 522 aa  300  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2391  hypothetical protein  33.06 
 
 		 471 aa  270  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0167986  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2182  hypothetical protein  38.59 
 
 		 455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2867  hypothetical protein  36.9 
 
 		 665 aa  243  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4005  hypothetical protein  43.82 
 
 		 423 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2352  hypothetical protein  36.33 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.289582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2184  Protein of unknown function DUF1800  32.69 
 
 		 503 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0521136  normal  0.739812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4696  Protein of unknown function DUF1800  33.33 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2474  Protein of unknown function DUF1800  32.13 
 
 		 503 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3316  Protein of unknown function DUF1800  35.14 
 
 		 533 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0376  Protein of unknown function DUF1800  33.5 
 
 		 664 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0773  Protein of unknown function DUF1800  32.88 
 
 		 643 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4978  hypothetical protein  30.69 
 
 		 495 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5179  hypothetical protein  36.68 
 
 		 507 aa  204  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4838  hypothetical protein  34.81 
 
 		 526 aa  203  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4117  Protein of unknown function DUF1800  33.48 
 
 		 526 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.970573  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2770  hypothetical protein  33.25 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.818772  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6010  hypothetical protein  36.05 
 
 		 533 aa  200  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4879  hypothetical protein  33.88 
 
 		 532 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0484616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02838  hypothetical protein  33.65 
 
 		 529 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2282  hypothetical protein  32.35 
 
 		 549 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349659  hitchhiker  0.0000222202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5539  hypothetical protein  34.35 
 
 		 508 aa  170  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101911  normal  0.180912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1682  hypothetical protein  33.13 
 
 		 525 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5247  hypothetical protein  34.46 
 
 		 500 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6143  hypothetical protein  34.46 
 
 		 500 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1936  hypothetical protein  34.46 
 
 		 500 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3875  Protein of unknown function DUF1800  34.75 
 
 		 483 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1960  hypothetical protein  34.18 
 
 		 500 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0216977  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1924  hypothetical protein  34.46 
 
 		 515 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947079  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1851  hypothetical protein  34.18 
 
 		 505 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942096  hitchhiker  0.000233455 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2096  hypothetical protein  33.92 
 
 		 471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2159  hypothetical protein  29.97 
 
 		 565 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2349  hypothetical protein  32.46 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.475225  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3483  hypothetical protein  29.69 
 
 		 553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2504  hypothetical protein  32.75 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2391  hypothetical protein  32.75 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2305  hypothetical protein  31.62 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1881  Protein of unknown function DUF1800  31.97 
 
 		 548 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.126804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1650  signal peptide protein  31.76 
 
 		 538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2721  hypothetical protein  33.43 
 
 		 572 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1250  hypothetical protein  32.16 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3328  hypothetical protein  32.16 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0104946  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1567  Protein of unknown function DUF1800  31.53 
 
 		 545 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00854272  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1977  hypothetical protein  32.16 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132542  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1484  hypothetical protein  32.16 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00691345  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1896  Protein of unknown function DUF1800  30.82 
 
 		 541 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018733  normal  0.180633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1975  hypothetical protein  33.03 
 
 		 460 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527872  normal  0.596923 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1335  hypothetical protein  33.84 
 
 		 503 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  decreased coverage  0.0000870574 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2472  Protein of unknown function DUF1800  31.5 
 
 		 404 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.230018  decreased coverage  0.00526107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0200  Protein of unknown function DUF1800  27.3 
 
 		 470 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3058  hypothetical protein  26.71 
 
 		 555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5993  Protein of unknown function DUF1800  30.07 
 
 		 478 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2279  hypothetical protein  32.63 
 
 		 311 aa  113  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000123054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2447  hypothetical protein  28.8 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0601208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4237  Protein of unknown function DUF1800  29.63 
 
 		 541 aa  109  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000229991  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1450  hypothetical protein  28.75 
 
 		 605 aa  107  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3566  hypothetical protein  30.18 
 
 		 668 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1188  Protein of unknown function DUF1800  26.99 
 
 		 453 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1610  hypothetical protein  31.69 
 
 		 455 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00247546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2115  Protein of unknown function DUF1800  29.6 
 
 		 628 aa  96.3  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0968  hypothetical protein  29.64 
 
 		 440 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1102  Protein of unknown function DUF1800  29.62 
 
 		 458 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1206  hypothetical protein  27.62 
 
 		 480 aa  93.2  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0519  hypothetical protein  21.73 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2550  Protein of unknown function DUF1800  26.03 
 
 		 654 aa  80.5  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.392949  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0047  Protein of unknown function DUF1800  25.56 
 
 		 545 aa  79.7  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0385288  normal  0.588647 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2237  hypothetical protein  25 
 
 		 653 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1788  Protein of unknown function DUF1800  30.71 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4704  hypothetical protein  28.2 
 
 		 647 aa  76.6  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2388  hypothetical protein  24.56 
 
 		 604 aa  73.9  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0166  Protein of unknown function DUF1800  30.86 
 
 		 555 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05702  hypothetical protein  26.7 
 
 		 520 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4494  hypothetical protein  29.17 
 
 		 635 aa  70.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000086  hypothetical protein  28.57 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06462  hypothetical protein  26.61 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  24.32 
 
 		 645 aa  65.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7109  Protein of unknown function DUF1800  23.62 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3513  hypothetical protein  27.54 
 
 		 587 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0370611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>