65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3363 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3363  hypothetical protein  100 
 
 		 578 aa  1195    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.174936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7109  Protein of unknown function DUF1800  29.72 
 
 		 548 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0047  Protein of unknown function DUF1800  30.8 
 
 		 545 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0385288  normal  0.588647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2305  hypothetical protein  27.37 
 
 		 513 aa  150  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1188  Protein of unknown function DUF1800  28.79 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1881  Protein of unknown function DUF1800  27.55 
 
 		 548 aa  147  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.126804 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1567  Protein of unknown function DUF1800  25.86 
 
 		 545 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00854272  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1650  signal peptide protein  25.43 
 
 		 538 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1896  Protein of unknown function DUF1800  24.78 
 
 		 541 aa  135  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018733  normal  0.180633 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2096  hypothetical protein  26.42 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1450  hypothetical protein  26.04 
 
 		 605 aa  124  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2349  hypothetical protein  25.98 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.475225  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2504  hypothetical protein  25.78 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2391  hypothetical protein  25.78 
 
 		 471 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1977  hypothetical protein  25.78 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132542  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3328  hypothetical protein  25.78 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0104946  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1484  hypothetical protein  25.78 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00691345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1250  hypothetical protein  25.78 
 
 		 471 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1335  hypothetical protein  27.04 
 
 		 503 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  decreased coverage  0.0000870574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1924  hypothetical protein  26.67 
 
 		 515 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947079  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4237  Protein of unknown function DUF1800  25.48 
 
 		 541 aa  117  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000229991  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5247  hypothetical protein  26.3 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1851  hypothetical protein  26.67 
 
 		 505 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942096  hitchhiker  0.000233455 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1960  hypothetical protein  26.67 
 
 		 500 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0216977  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1936  hypothetical protein  26.67 
 
 		 500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6143  hypothetical protein  26.67 
 
 		 500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1102  Protein of unknown function DUF1800  25.27 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2237  hypothetical protein  26.37 
 
 		 653 aa  105  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2550  Protein of unknown function DUF1800  26.12 
 
 		 654 aa  103  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.392949  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1610  hypothetical protein  26.48 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00247546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0200  Protein of unknown function DUF1800  24.78 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2472  Protein of unknown function DUF1800  24.52 
 
 		 404 aa  99  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.230018  decreased coverage  0.00526107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3566  hypothetical protein  25.37 
 
 		 668 aa  97.4  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3483  hypothetical protein  26.63 
 
 		 553 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0519  hypothetical protein  25.57 
 
 		 465 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5993  Protein of unknown function DUF1800  25.4 
 
 		 478 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2159  hypothetical protein  27.05 
 
 		 565 aa  90.5  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2115  Protein of unknown function DUF1800  25.41 
 
 		 628 aa  90.1  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2279  hypothetical protein  27.67 
 
 		 311 aa  88.2  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000123054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1788  Protein of unknown function DUF1800  25.82 
 
 		 435 aa  87.4  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2447  hypothetical protein  23.16 
 
 		 399 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0601208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3058  hypothetical protein  26.42 
 
 		 555 aa  73.6  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417569  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02838  hypothetical protein  24.93 
 
 		 529 aa  69.7  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0968  hypothetical protein  27.47 
 
 		 440 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0166  Protein of unknown function DUF1800  25.42 
 
 		 555 aa  65.1  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4879  hypothetical protein  23.68 
 
 		 532 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0484616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1682  hypothetical protein  21.67 
 
 		 525 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4838  hypothetical protein  23.9 
 
 		 526 aa  62  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2721  hypothetical protein  24.35 
 
 		 572 aa  61.6  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4117  Protein of unknown function DUF1800  23.05 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.970573  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1206  hypothetical protein  24.8 
 
 		 480 aa  56.6  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5539  hypothetical protein  23.33 
 
 		 508 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101911  normal  0.180912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4696  Protein of unknown function DUF1800  20.38 
 
 		 457 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6010  hypothetical protein  22.07 
 
 		 533 aa  56.2  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2770  hypothetical protein  22.03 
 
 		 454 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.818772  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3875  Protein of unknown function DUF1800  22.74 
 
 		 483 aa  53.9  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620003 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2282  hypothetical protein  21.66 
 
 		 549 aa  51.6  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349659  hitchhiker  0.0000222202 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0773  Protein of unknown function DUF1800  25.18 
 
 		 643 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4978  hypothetical protein  21.47 
 
 		 495 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5179  hypothetical protein  23.64 
 
 		 507 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2867  hypothetical protein  22.58 
 
 		 665 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3316  Protein of unknown function DUF1800  22.28 
 
 		 533 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0376  Protein of unknown function DUF1800  24.49 
 
 		 664 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3513  hypothetical protein  28.91 
 
 		 587 aa  48.9  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0370611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2184  Protein of unknown function DUF1800  35.71 
 
 		 503 aa  44.3  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0521136  normal  0.739812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>