93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3316 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3316  Protein of unknown function DUF1800  100 
 
 		 533 aa  1075    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6010  hypothetical protein  59.85 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2282  hypothetical protein  58.75 
 
 		 549 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349659  hitchhiker  0.0000222202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4117  Protein of unknown function DUF1800  53.94 
 
 		 526 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.970573  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4838  hypothetical protein  53.1 
 
 		 526 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5179  hypothetical protein  55.58 
 
 		 507 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4879  hypothetical protein  52.38 
 
 		 532 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0484616  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5539  hypothetical protein  55.32 
 
 		 508 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101911  normal  0.180912 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02838  hypothetical protein  46.28 
 
 		 529 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4696  Protein of unknown function DUF1800  36.78 
 
 		 457 aa  280  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2770  hypothetical protein  36.01 
 
 		 454 aa  269  8.999999999999999e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.818772  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4978  hypothetical protein  33.8 
 
 		 495 aa  260  5.0000000000000005e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2867  hypothetical protein  40.62 
 
 		 665 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0773  Protein of unknown function DUF1800  35.43 
 
 		 643 aa  239  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0376  Protein of unknown function DUF1800  32.82 
 
 		 664 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4216  hypothetical protein  35.47 
 
 		 454 aa  229  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1793  hypothetical protein  37.76 
 
 		 511 aa  223  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5827  hypothetical protein  36.08 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0551866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3892  hypothetical protein  35.61 
 
 		 464 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4476  hypothetical protein  35.61 
 
 		 464 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4377  hypothetical protein  35.14 
 
 		 464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.877335 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3913  hypothetical protein  35.14 
 
 		 464 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1384  hypothetical protein  34.61 
 
 		 535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478917  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1682  hypothetical protein  36.1 
 
 		 525 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5024  Protein of unknown function DUF1800  33.65 
 
 		 519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0654907  normal  0.102883 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5240  hypothetical protein  35.83 
 
 		 524 aa  200  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.091934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3442  Protein of unknown function DUF1800  33.64 
 
 		 496 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24616  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4087  hypothetical protein  33.26 
 
 		 500 aa  197  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1626  hypothetical protein  33.41 
 
 		 507 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0161369  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4005  hypothetical protein  34.61 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3875  Protein of unknown function DUF1800  32.39 
 
 		 483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1975  hypothetical protein  37.78 
 
 		 460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527872  normal  0.596923 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2721  hypothetical protein  35.77 
 
 		 572 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2182  hypothetical protein  33.42 
 
 		 455 aa  169  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2184  Protein of unknown function DUF1800  30.08 
 
 		 503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0521136  normal  0.739812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2159  hypothetical protein  30.68 
 
 		 565 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2851  hypothetical protein  28.67 
 
 		 471 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2391  hypothetical protein  27.18 
 
 		 471 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0167986  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2339  hypothetical protein  31.95 
 
 		 522 aa  157  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428867  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2474  Protein of unknown function DUF1800  32.97 
 
 		 503 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2349  hypothetical protein  35.42 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.475225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2391  hypothetical protein  35.42 
 
 		 471 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2504  hypothetical protein  35.42 
 
 		 467 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2352  hypothetical protein  29.41 
 
 		 448 aa  151  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.289582 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1977  hypothetical protein  35.11 
 
 		 487 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132542  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3328  hypothetical protein  35.11 
 
 		 487 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0104946  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1250  hypothetical protein  35.11 
 
 		 471 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1484  hypothetical protein  35.11 
 
 		 467 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00691345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3483  hypothetical protein  29.66 
 
 		 553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2096  hypothetical protein  35.31 
 
 		 471 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3058  hypothetical protein  29.03 
 
 		 555 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417569  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4237  Protein of unknown function DUF1800  32.39 
 
 		 541 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000229991  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1936  hypothetical protein  33.25 
 
 		 500 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6143  hypothetical protein  33.25 
 
 		 500 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1881  Protein of unknown function DUF1800  34.64 
 
 		 548 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.126804 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1924  hypothetical protein  33.33 
 
 		 515 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2305  hypothetical protein  33.53 
 
 		 513 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5247  hypothetical protein  33.52 
 
 		 500 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2472  Protein of unknown function DUF1800  35.06 
 
 		 404 aa  137  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.230018  decreased coverage  0.00526107 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1851  hypothetical protein  33.62 
 
 		 505 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942096  hitchhiker  0.000233455 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1960  hypothetical protein  33.53 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0216977  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1567  Protein of unknown function DUF1800  34.02 
 
 		 545 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00854272  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1896  Protein of unknown function DUF1800  34.74 
 
 		 541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018733  normal  0.180633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0200  Protein of unknown function DUF1800  31.83 
 
 		 470 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1650  signal peptide protein  31.47 
 
 		 538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1335  hypothetical protein  34.29 
 
 		 503 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  decreased coverage  0.0000870574 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1206  hypothetical protein  29.31 
 
 		 480 aa  123  9e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5993  Protein of unknown function DUF1800  29.97 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2279  hypothetical protein  33.8 
 
 		 311 aa  120  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000123054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1102  Protein of unknown function DUF1800  31.53 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3566  hypothetical protein  32.82 
 
 		 668 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0519  hypothetical protein  24.94 
 
 		 465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2447  hypothetical protein  32.56 
 
 		 399 aa  114  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0601208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2115  Protein of unknown function DUF1800  29.72 
 
 		 628 aa  114  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1610  hypothetical protein  32.42 
 
 		 455 aa  113  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00247546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1188  Protein of unknown function DUF1800  31.44 
 
 		 453 aa  110  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0047  Protein of unknown function DUF1800  32.96 
 
 		 545 aa  107  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0385288  normal  0.588647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0968  hypothetical protein  30.47 
 
 		 440 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1450  hypothetical protein  30.16 
 
 		 605 aa  103  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2550  Protein of unknown function DUF1800  27.91 
 
 		 654 aa  103  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.392949  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7109  Protein of unknown function DUF1800  30.12 
 
 		 548 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2237  hypothetical protein  26.44 
 
 		 653 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1788  Protein of unknown function DUF1800  27.61 
 
 		 435 aa  87  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2388  hypothetical protein  26.64 
 
 		 604 aa  82.8  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4494  hypothetical protein  33.64 
 
 		 635 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05702  hypothetical protein  29.77 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0166  Protein of unknown function DUF1800  30.54 
 
 		 555 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4704  hypothetical protein  30.61 
 
 		 647 aa  73.6  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06462  hypothetical protein  26.81 
 
 		 494 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  27.05 
 
 		 645 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000086  hypothetical protein  30.8 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3513  hypothetical protein  28.62 
 
 		 587 aa  66.6  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0370611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3363  hypothetical protein  22.16 
 
 		 578 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.174936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>