93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5179 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5539  hypothetical protein  73.18 
 
 
508 aa  635    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101911  normal  0.180912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5179  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  996    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4117  Protein of unknown function DUF1800  60.12 
 
 
526 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.970573  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3316  Protein of unknown function DUF1800  54.22 
 
 
533 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6010  hypothetical protein  50.1 
 
 
533 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2282  hypothetical protein  49.71 
 
 
549 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349659  hitchhiker  0.0000222202 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4838  hypothetical protein  46.32 
 
 
526 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4879  hypothetical protein  46.41 
 
 
532 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0484616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02838  hypothetical protein  42.38 
 
 
529 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4696  Protein of unknown function DUF1800  36.57 
 
 
457 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2770  hypothetical protein  34.94 
 
 
454 aa  250  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.818772  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4978  hypothetical protein  33.81 
 
 
495 aa  233  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402052  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4377  hypothetical protein  36.68 
 
 
464 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.877335 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3913  hypothetical protein  36.45 
 
 
464 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4476  hypothetical protein  35.98 
 
 
464 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4216  hypothetical protein  36.4 
 
 
454 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3892  hypothetical protein  35.98 
 
 
464 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5024  Protein of unknown function DUF1800  35.49 
 
 
519 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0654907  normal  0.102883 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5827  hypothetical protein  35.75 
 
 
464 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0551866  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2867  hypothetical protein  31.45 
 
 
665 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1384  hypothetical protein  35.03 
 
 
535 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478917  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3442  Protein of unknown function DUF1800  34.29 
 
 
496 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24616  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0773  Protein of unknown function DUF1800  29.36 
 
 
643 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4087  hypothetical protein  35.14 
 
 
500 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1626  hypothetical protein  35.07 
 
 
507 aa  191  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0161369  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0376  Protein of unknown function DUF1800  29.75 
 
 
664 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1682  hypothetical protein  31.71 
 
 
525 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1793  hypothetical protein  33.12 
 
 
511 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4005  hypothetical protein  35.38 
 
 
423 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5240  hypothetical protein  34.67 
 
 
524 aa  169  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.091934  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3875  Protein of unknown function DUF1800  31.23 
 
 
483 aa  156  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620003 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2339  hypothetical protein  33.25 
 
 
522 aa  151  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2391  hypothetical protein  28.8 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0167986  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2851  hypothetical protein  29.42 
 
 
471 aa  146  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2721  hypothetical protein  32.02 
 
 
572 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2184  Protein of unknown function DUF1800  32.3 
 
 
503 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0521136  normal  0.739812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3483  hypothetical protein  30.3 
 
 
553 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2352  hypothetical protein  31.64 
 
 
448 aa  139  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.289582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1975  hypothetical protein  31.93 
 
 
460 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527872  normal  0.596923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2474  Protein of unknown function DUF1800  33.98 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1881  Protein of unknown function DUF1800  33.33 
 
 
548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.126804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2182  hypothetical protein  31.33 
 
 
455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2349  hypothetical protein  33.66 
 
 
471 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.475225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1936  hypothetical protein  31.07 
 
 
500 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2504  hypothetical protein  33.66 
 
 
467 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5247  hypothetical protein  31.17 
 
 
500 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.683249  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2305  hypothetical protein  32.35 
 
 
513 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6143  hypothetical protein  31.07 
 
 
500 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2391  hypothetical protein  33.66 
 
 
471 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2096  hypothetical protein  34.54 
 
 
471 aa  127  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3328  hypothetical protein  34.01 
 
 
487 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0104946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2159  hypothetical protein  31.97 
 
 
565 aa  126  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1977  hypothetical protein  34.01 
 
 
487 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132542  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1250  hypothetical protein  34.01 
 
 
471 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1484  hypothetical protein  34.01 
 
 
467 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00691345  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1206  hypothetical protein  28.53 
 
 
480 aa  125  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1960  hypothetical protein  31.4 
 
 
500 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0216977  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3058  hypothetical protein  25.88 
 
 
555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417569  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1851  hypothetical protein  31.95 
 
 
505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942096  hitchhiker  0.000233455 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1924  hypothetical protein  31.72 
 
 
515 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947079  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1335  hypothetical protein  33.85 
 
 
503 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  decreased coverage  0.0000870574 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2279  hypothetical protein  31.38 
 
 
311 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000123054  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4237  Protein of unknown function DUF1800  31.17 
 
 
541 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000229991  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1567  Protein of unknown function DUF1800  29.71 
 
 
545 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00854272  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1896  Protein of unknown function DUF1800  28.78 
 
 
541 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018733  normal  0.180633 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1450  hypothetical protein  30.19 
 
 
605 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0519  hypothetical protein  22.2 
 
 
465 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0200  Protein of unknown function DUF1800  27.64 
 
 
470 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1650  signal peptide protein  28.25 
 
 
538 aa  103  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2472  Protein of unknown function DUF1800  33.77 
 
 
404 aa  103  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.230018  decreased coverage  0.00526107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0047  Protein of unknown function DUF1800  29.9 
 
 
545 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0385288  normal  0.588647 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2115  Protein of unknown function DUF1800  28.17 
 
 
628 aa  100  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5993  Protein of unknown function DUF1800  27.46 
 
 
478 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000086  hypothetical protein  27.71 
 
 
522 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3566  hypothetical protein  28.47 
 
 
668 aa  95.1  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2447  hypothetical protein  31.89 
 
 
399 aa  94.7  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0601208  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05702  hypothetical protein  26.61 
 
 
520 aa  93.2  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2388  hypothetical protein  27.11 
 
 
604 aa  93.2  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1102  Protein of unknown function DUF1800  30.67 
 
 
458 aa  93.2  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178518  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2550  Protein of unknown function DUF1800  27.3 
 
 
654 aa  88.6  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.392949  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1610  hypothetical protein  34.73 
 
 
455 aa  87.8  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00247546  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1188  Protein of unknown function DUF1800  27.95 
 
 
453 aa  87  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25129  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4494  hypothetical protein  33.63 
 
 
635 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06462  hypothetical protein  28.57 
 
 
494 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2237  hypothetical protein  32.66 
 
 
653 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  30.5 
 
 
645 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7109  Protein of unknown function DUF1800  27.64 
 
 
548 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0968  hypothetical protein  29.66 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248356  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4704  hypothetical protein  31.58 
 
 
647 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0166  Protein of unknown function DUF1800  27.78 
 
 
555 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450807  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1788  Protein of unknown function DUF1800  33.18 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3513  hypothetical protein  28.37 
 
 
587 aa  69.3  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0370611  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3363  hypothetical protein  23.64 
 
 
578 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.174936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>